Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
DDB1Q16531 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
DDB1Q16531 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
DDB1Q16531 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
DDB1Q16531 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
DDB1Q16531 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
DDB1Q16531 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
DDB1Q16531 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
DDB1Q16531 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
DDB1Q16531 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
DDB1Q16531 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
DDB1Q16531 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
DDB1Q16531 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
DDB1Q16531 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
DDB1Q16531 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
DDB1Q16531 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
DDB1Q16531 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
DDB1Q16531 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
DDB1Q16531 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
DDB1Q16531 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
DDB1Q16531 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
DDB1Q16531 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
DDB1Q16531 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
DDB1Q16531 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
DDB1Q16531 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
DDB1Q16531 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
DDB1Q16531 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
DDB1Q16531 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
DDB1Q16531 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
DDB1Q16531 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
DDB1Q16531 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
DDB1Q16531 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
DDB1Q16531 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
DDB1Q16531 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
DDB1Q16531 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
DDB1Q16531 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
DDB1Q16531 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
DDB1Q16531 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
DDB1Q16531 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
DDB1Q16531 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
DDB1Q16531 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
DDB1Q16531 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
DDB1Q16531 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
DDB1Q16531 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
DDB1Q16531 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
DDB1Q16531 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
DDB1Q16531 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
DDB1Q16531 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
DDB1Q16531 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
DDB1Q16531 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
DDB1Q16531 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
DDB1Q16531 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
DDB1Q16531 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
DDB1Q16531 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
DDB1Q16531 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
DDB1Q16531 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
DDB1Q16531 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
DDB1Q16531 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
DDB1Q16531 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
DDB1Q16531 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
DDB1Q16531 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
DDB1Q16531 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
DDB1Q16531 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
DDB1Q16531 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
DDB1Q16531 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
DDB1Q16531 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
DDB1Q16531 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
DDB1Q16531 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
DDB1Q16531 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
DDB1Q16531 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
DDB1Q16531 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
DDB1Q16531 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
DDB1Q16531 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
DDB1Q16531 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
DDB1Q16531 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
DDB1Q16531 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
DDB1Q16531 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
DDB1Q16531 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
DDB1Q16531 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
DDB1Q16531 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
DDB1Q16531 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
DDB1Q16531 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
DDB1Q16531 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
DDB1Q16531 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
DDB1Q16531 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
DDB1Q16531 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
DDB1Q16531 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
DDB1Q16531 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
DDB1Q16531 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
DDB1Q16531 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
DDB1Q16531 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
DDB1Q16531 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
DDB1Q16531 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
DDB1Q16531 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
DDB1Q16531 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
DDB1Q16531 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
DDB1Q16531 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
DDB1Q16531 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
DDB1Q16531 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
DDB1Q16531 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
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