Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CHRNA2Q15822 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CHRNA2Q15822 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CHRNA2Q15822 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CHRNA2Q15822 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CHRNA2Q15822 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CHRNA2Q15822 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CHRNA2Q15822 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CHRNA2Q15822 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CHRNA2Q15822 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CHRNA2Q15822 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CHRNA2Q15822 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CHRNA2Q15822 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CHRNA2Q15822 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CHRNA2Q15822 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CHRNA2Q15822 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CHRNA2Q15822 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CHRNA2Q15822 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CHRNA2Q15822 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CHRNA2Q15822 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CHRNA2Q15822 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CHRNA2Q15822 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CHRNA2Q15822 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CHRNA2Q15822 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
CHRNA2Q15822 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CHRNA2Q15822 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CHRNA2Q15822 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CHRNA2Q15822 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CHRNA2Q15822 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CHRNA2Q15822 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CHRNA2Q15822 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHRNA2Q15822 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHRNA2Q15822 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHRNA2Q15822 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHRNA2Q15822 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHRNA2Q15822 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHRNA2Q15822 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHRNA2Q15822 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHRNA2Q15822 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHRNA2Q15822 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHRNA2Q15822 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CHRNA2Q15822 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CHRNA2Q15822 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CHRNA2Q15822 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CHRNA2Q15822 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CHRNA2Q15822 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CHRNA2Q15822 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CHRNA2Q15822 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CHRNA2Q15822 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CHRNA2Q15822 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CHRNA2Q15822 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CHRNA2Q15822 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CHRNA2Q15822 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CHRNA2Q15822 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CHRNA2Q15822 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CHRNA2Q15822 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
CHRNA2Q15822 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CHRNA2Q15822 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
CHRNA2Q15822 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CHRNA2Q15822 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CHRNA2Q15822 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CHRNA2Q15822 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CHRNA2Q15822 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CHRNA2Q15822 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CHRNA2Q15822 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CHRNA2Q15822 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CHRNA2Q15822 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CHRNA2Q15822 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CHRNA2Q15822 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CHRNA2Q15822 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CHRNA2Q15822 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CHRNA2Q15822 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CHRNA2Q15822 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CHRNA2Q15822 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CHRNA2Q15822 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CHRNA2Q15822 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CHRNA2Q15822 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CHRNA2Q15822 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CHRNA2Q15822 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CHRNA2Q15822 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CHRNA2Q15822 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CHRNA2Q15822 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CHRNA2Q15822 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CHRNA2Q15822 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CHRNA2Q15822 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CHRNA2Q15822 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CHRNA2Q15822 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CHRNA2Q15822 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CHRNA2Q15822 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CHRNA2Q15822 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CHRNA2Q15822 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CHRNA2Q15822 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
CHRNA2Q15822 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CHRNA2Q15822 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CHRNA2Q15822 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CHRNA2Q15822 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CHRNA2Q15822 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CHRNA2Q15822 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHRNA2Q15822 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHRNA2Q15822 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms