Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIP11Q15643 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIP11Q15643 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIP11Q15643 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIP11Q15643 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIP11Q15643 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIP11Q15643 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIP11Q15643 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIP11Q15643 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIP11Q15643 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIP11Q15643 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIP11Q15643 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIP11Q15643 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIP11Q15643 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIP11Q15643 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIP11Q15643 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIP11Q15643 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIP11Q15643 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIP11Q15643 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIP11Q15643 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIP11Q15643 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TRIP11Q15643 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TRIP11Q15643 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIP11Q15643 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIP11Q15643 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIP11Q15643 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIP11Q15643 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIP11Q15643 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIP11Q15643 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIP11Q15643 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIP11Q15643 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIP11Q15643 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIP11Q15643 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIP11Q15643 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIP11Q15643 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIP11Q15643 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIP11Q15643 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIP11Q15643 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIP11Q15643 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIP11Q15643 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIP11Q15643 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIP11Q15643 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIP11Q15643 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIP11Q15643 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIP11Q15643 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIP11Q15643 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIP11Q15643 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIP11Q15643 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIP11Q15643 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIP11Q15643 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRIP11Q15643 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRIP11Q15643 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRIP11Q15643 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIP11Q15643 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIP11Q15643 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIP11Q15643 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIP11Q15643 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIP11Q15643 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIP11Q15643 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIP11Q15643 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIP11Q15643 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIP11Q15643 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIP11Q15643 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIP11Q15643 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIP11Q15643 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIP11Q15643 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIP11Q15643 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIP11Q15643 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIP11Q15643 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIP11Q15643 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIP11Q15643 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIP11Q15643 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIP11Q15643 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIP11Q15643 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIP11Q15643 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIP11Q15643 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIP11Q15643 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIP11Q15643 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIP11Q15643 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIP11Q15643 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIP11Q15643 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIP11Q15643 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIP11Q15643 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIP11Q15643 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIP11Q15643 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIP11Q15643 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIP11Q15643 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIP11Q15643 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIP11Q15643 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIP11Q15643 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRIP11Q15643 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRIP11Q15643 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRIP11Q15643 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIP11Q15643 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIP11Q15643 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIP11Q15643 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIP11Q15643 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIP11Q15643 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIP11Q15643 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIP11Q15643 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms