Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIP10Q15642 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIP10Q15642 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIP10Q15642 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIP10Q15642 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIP10Q15642 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIP10Q15642 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIP10Q15642 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIP10Q15642 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIP10Q15642 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIP10Q15642 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIP10Q15642 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIP10Q15642 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIP10Q15642 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIP10Q15642 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIP10Q15642 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIP10Q15642 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIP10Q15642 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIP10Q15642 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIP10Q15642 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIP10Q15642 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIP10Q15642 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIP10Q15642 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIP10Q15642 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIP10Q15642 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIP10Q15642 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIP10Q15642 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIP10Q15642 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIP10Q15642 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIP10Q15642 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIP10Q15642 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIP10Q15642 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIP10Q15642 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIP10Q15642 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIP10Q15642 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIP10Q15642 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIP10Q15642 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIP10Q15642 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIP10Q15642 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIP10Q15642 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIP10Q15642 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIP10Q15642 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIP10Q15642 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIP10Q15642 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIP10Q15642 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIP10Q15642 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIP10Q15642 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIP10Q15642 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIP10Q15642 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIP10Q15642 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIP10Q15642 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIP10Q15642 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIP10Q15642 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIP10Q15642 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIP10Q15642 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIP10Q15642 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIP10Q15642 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIP10Q15642 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIP10Q15642 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIP10Q15642 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIP10Q15642 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIP10Q15642 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIP10Q15642 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIP10Q15642 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIP10Q15642 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIP10Q15642 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIP10Q15642 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIP10Q15642 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIP10Q15642 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIP10Q15642 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIP10Q15642 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIP10Q15642 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIP10Q15642 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIP10Q15642 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIP10Q15642 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIP10Q15642 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIP10Q15642 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIP10Q15642 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIP10Q15642 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIP10Q15642 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIP10Q15642 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIP10Q15642 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIP10Q15642 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIP10Q15642 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIP10Q15642 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIP10Q15642 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIP10Q15642 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIP10Q15642 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIP10Q15642 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIP10Q15642 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIP10Q15642 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIP10Q15642 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIP10Q15642 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIP10Q15642 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIP10Q15642 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIP10Q15642 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIP10Q15642 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIP10Q15642 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIP10Q15642 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIP10Q15642 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms