Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNN3Q15417 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNN3Q15417 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNN3Q15417 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNN3Q15417 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNN3Q15417 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNN3Q15417 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNN3Q15417 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNN3Q15417 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNN3Q15417 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNN3Q15417 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNN3Q15417 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNN3Q15417 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNN3Q15417 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNN3Q15417 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNN3Q15417 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNN3Q15417 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNN3Q15417 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNN3Q15417 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNN3Q15417 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNN3Q15417 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNN3Q15417 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNN3Q15417 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNN3Q15417 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNN3Q15417 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNN3Q15417 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNN3Q15417 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNN3Q15417 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNN3Q15417 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNN3Q15417 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNN3Q15417 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNN3Q15417 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNN3Q15417 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNN3Q15417 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNN3Q15417 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNN3Q15417 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNN3Q15417 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNN3Q15417 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNN3Q15417 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNN3Q15417 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNN3Q15417 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNN3Q15417 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNN3Q15417 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNN3Q15417 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNN3Q15417 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNN3Q15417 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNN3Q15417 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNN3Q15417 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNN3Q15417 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNN3Q15417 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNN3Q15417 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNN3Q15417 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNN3Q15417 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNN3Q15417 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNN3Q15417 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNN3Q15417 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNN3Q15417 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNN3Q15417 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNN3Q15417 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNN3Q15417 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNN3Q15417 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNN3Q15417 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNN3Q15417 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNN3Q15417 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNN3Q15417 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNN3Q15417 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNN3Q15417 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNN3Q15417 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNN3Q15417 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNN3Q15417 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNN3Q15417 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNN3Q15417 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNN3Q15417 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNN3Q15417 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNN3Q15417 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNN3Q15417 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNN3Q15417 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNN3Q15417 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNN3Q15417 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNN3Q15417 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNN3Q15417 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNN3Q15417 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNN3Q15417 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNN3Q15417 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNN3Q15417 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNN3Q15417 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNN3Q15417 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNN3Q15417 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNN3Q15417 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNN3Q15417 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNN3Q15417 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNN3Q15417 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNN3Q15417 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNN3Q15417 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNN3Q15417 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNN3Q15417 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNN3Q15417 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNN3Q15417 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNN3Q15417 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNN3Q15417 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
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