Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TTF1Q15361 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TTF1Q15361 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TTF1Q15361 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TTF1Q15361 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TTF1Q15361 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TTF1Q15361 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
TTF1Q15361 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TTF1Q15361 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TTF1Q15361 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TTF1Q15361 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TTF1Q15361 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TTF1Q15361 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TTF1Q15361 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TTF1Q15361 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TTF1Q15361 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TTF1Q15361 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TTF1Q15361 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TTF1Q15361 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
TTF1Q15361 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TTF1Q15361 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TTF1Q15361 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TTF1Q15361 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TTF1Q15361 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TTF1Q15361 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TTF1Q15361 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TTF1Q15361 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TTF1Q15361 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TTF1Q15361 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TTF1Q15361 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TTF1Q15361 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TTF1Q15361 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TTF1Q15361 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TTF1Q15361 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
TTF1Q15361 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TTF1Q15361 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TTF1Q15361 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TTF1Q15361 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
TTF1Q15361 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TTF1Q15361 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TTF1Q15361 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TTF1Q15361 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TTF1Q15361 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TTF1Q15361 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TTF1Q15361 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TTF1Q15361 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TTF1Q15361 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TTF1Q15361 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TTF1Q15361 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TTF1Q15361 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TTF1Q15361 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TTF1Q15361 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TTF1Q15361 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TTF1Q15361 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TTF1Q15361 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
TTF1Q15361 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TTF1Q15361 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TTF1Q15361 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TTF1Q15361 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
TTF1Q15361 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TTF1Q15361 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TTF1Q15361 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TTF1Q15361 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TTF1Q15361 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TTF1Q15361 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TTF1Q15361 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TTF1Q15361 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TTF1Q15361 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TTF1Q15361 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TTF1Q15361 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
TTF1Q15361 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TTF1Q15361 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TTF1Q15361 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TTF1Q15361 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TTF1Q15361 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TTF1Q15361 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TTF1Q15361 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TTF1Q15361 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TTF1Q15361 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TTF1Q15361 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TTF1Q15361 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TTF1Q15361 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TTF1Q15361 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TTF1Q15361 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TTF1Q15361 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TTF1Q15361 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TTF1Q15361 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TTF1Q15361 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TTF1Q15361 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TTF1Q15361 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
TTF1Q15361 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TTF1Q15361 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TTF1Q15361 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
TTF1Q15361 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TTF1Q15361 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TTF1Q15361 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TTF1Q15361 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TTF1Q15361 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TTF1Q15361 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TTF1Q15361 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
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