Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCOLCEQ15113 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCOLCEQ15113 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCOLCEQ15113 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCOLCEQ15113 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCOLCEQ15113 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCOLCEQ15113 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCOLCEQ15113 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCOLCEQ15113 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCOLCEQ15113 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCOLCEQ15113 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCOLCEQ15113 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCOLCEQ15113 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCOLCEQ15113 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCOLCEQ15113 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCOLCEQ15113 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCOLCEQ15113 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCOLCEQ15113 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCOLCEQ15113 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCOLCEQ15113 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCOLCEQ15113 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCOLCEQ15113 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCOLCEQ15113 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCOLCEQ15113 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCOLCEQ15113 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PCOLCEQ15113 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCOLCEQ15113 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCOLCEQ15113 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCOLCEQ15113 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCOLCEQ15113 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCOLCEQ15113 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCOLCEQ15113 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCOLCEQ15113 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCOLCEQ15113 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCOLCEQ15113 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCOLCEQ15113 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCOLCEQ15113 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCOLCEQ15113 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCOLCEQ15113 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCOLCEQ15113 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCOLCEQ15113 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCOLCEQ15113 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCOLCEQ15113 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PCOLCEQ15113 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCOLCEQ15113 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PCOLCEQ15113 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCOLCEQ15113 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCOLCEQ15113 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCOLCEQ15113 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCOLCEQ15113 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCOLCEQ15113 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCOLCEQ15113 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCOLCEQ15113 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCOLCEQ15113 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PCOLCEQ15113 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCOLCEQ15113 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCOLCEQ15113 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PCOLCEQ15113 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PCOLCEQ15113 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PCOLCEQ15113 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCOLCEQ15113 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCOLCEQ15113 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCOLCEQ15113 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCOLCEQ15113 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCOLCEQ15113 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCOLCEQ15113 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCOLCEQ15113 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCOLCEQ15113 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCOLCEQ15113 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCOLCEQ15113 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCOLCEQ15113 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCOLCEQ15113 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCOLCEQ15113 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCOLCEQ15113 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCOLCEQ15113 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCOLCEQ15113 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PCOLCEQ15113 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PCOLCEQ15113 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCOLCEQ15113 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCOLCEQ15113 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCOLCEQ15113 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCOLCEQ15113 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCOLCEQ15113 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCOLCEQ15113 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCOLCEQ15113 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCOLCEQ15113 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCOLCEQ15113 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCOLCEQ15113 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PCOLCEQ15113 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PCOLCEQ15113 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCOLCEQ15113 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCOLCEQ15113 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PCOLCEQ15113 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCOLCEQ15113 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCOLCEQ15113 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCOLCEQ15113 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCOLCEQ15113 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCOLCEQ15113 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCOLCEQ15113 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCOLCEQ15113 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
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