Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC44.56■■■■■ 4.72
GAPVD1Q14C86 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
GAPVD1Q14C86 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC44.54■■■■■ 4.72
GAPVD1Q14C86 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
GAPVD1Q14C86 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.52■■■■■ 4.72
GAPVD1Q14C86 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
GAPVD1Q14C86 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
GAPVD1Q14C86 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
GAPVD1Q14C86 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
GAPVD1Q14C86 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC44.46■■■■■ 4.71
GAPVD1Q14C86 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC44.45■■■■■ 4.71
GAPVD1Q14C86 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
GAPVD1Q14C86 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.71
GAPVD1Q14C86 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
GAPVD1Q14C86 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.7
GAPVD1Q14C86 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.44■■■■■ 4.7
GAPVD1Q14C86 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
GAPVD1Q14C86 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
GAPVD1Q14C86 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
GAPVD1Q14C86 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
GAPVD1Q14C86 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
GAPVD1Q14C86 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
GAPVD1Q14C86 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
GAPVD1Q14C86 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
GAPVD1Q14C86 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
GAPVD1Q14C86 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
GAPVD1Q14C86 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
GAPVD1Q14C86 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
GAPVD1Q14C86 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
GAPVD1Q14C86 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
GAPVD1Q14C86 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
GAPVD1Q14C86 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC44.38■■■■■ 4.69
GAPVD1Q14C86 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
GAPVD1Q14C86 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.36■■■■■ 4.69
GAPVD1Q14C86 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC44.34■■■■■ 4.69
GAPVD1Q14C86 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC44.3■■■■■ 4.68
GAPVD1Q14C86 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
GAPVD1Q14C86 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC44.27■■■■■ 4.68
GAPVD1Q14C86 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
GAPVD1Q14C86 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC44.27■■■■■ 4.68
GAPVD1Q14C86 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
GAPVD1Q14C86 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
GAPVD1Q14C86 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
GAPVD1Q14C86 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.68
GAPVD1Q14C86 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
GAPVD1Q14C86 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
GAPVD1Q14C86 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC44.24■■■■■ 4.67
GAPVD1Q14C86 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
GAPVD1Q14C86 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
GAPVD1Q14C86 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC44.22■■■■■ 4.67
GAPVD1Q14C86 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
GAPVD1Q14C86 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
GAPVD1Q14C86 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.2■■■■■ 4.67
GAPVD1Q14C86 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.67
GAPVD1Q14C86 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
GAPVD1Q14C86 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
GAPVD1Q14C86 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
GAPVD1Q14C86 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC44.15■■■■■ 4.66
GAPVD1Q14C86 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
GAPVD1Q14C86 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
GAPVD1Q14C86 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC44.15■■■■■ 4.66
GAPVD1Q14C86 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
GAPVD1Q14C86 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
GAPVD1Q14C86 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
GAPVD1Q14C86 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
GAPVD1Q14C86 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
GAPVD1Q14C86 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC44.11■■■■■ 4.65
GAPVD1Q14C86 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
GAPVD1Q14C86 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
GAPVD1Q14C86 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC44.08■■■■■ 4.65
GAPVD1Q14C86 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.64
GAPVD1Q14C86 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.06■■■■■ 4.64
GAPVD1Q14C86 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC44.06■■■■■ 4.64
GAPVD1Q14C86 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
GAPVD1Q14C86 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC44.04■■■■■ 4.64
GAPVD1Q14C86 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
GAPVD1Q14C86 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
GAPVD1Q14C86 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
GAPVD1Q14C86 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC44.01■■■■■ 4.64
GAPVD1Q14C86 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
GAPVD1Q14C86 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
GAPVD1Q14C86 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC43.99■■■■■ 4.63
GAPVD1Q14C86 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
GAPVD1Q14C86 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
GAPVD1Q14C86 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
GAPVD1Q14C86 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC43.95■■■■■ 4.63
GAPVD1Q14C86 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC43.94■■■■■ 4.62
GAPVD1Q14C86 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
GAPVD1Q14C86 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
GAPVD1Q14C86 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
GAPVD1Q14C86 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC43.92■■■■■ 4.62
GAPVD1Q14C86 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.92■■■■■ 4.62
GAPVD1Q14C86 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC43.92■■■■■ 4.62
GAPVD1Q14C86 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
GAPVD1Q14C86 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
GAPVD1Q14C86 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
GAPVD1Q14C86 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC43.89■■■■■ 4.62
GAPVD1Q14C86 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.88■■■■■ 4.62
GAPVD1Q14C86 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
GAPVD1Q14C86 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC43.86■■■■■ 4.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms