Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
SHPRHQ149N8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SHPRHQ149N8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SHPRHQ149N8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SHPRHQ149N8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SHPRHQ149N8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SHPRHQ149N8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SHPRHQ149N8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SHPRHQ149N8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SHPRHQ149N8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SHPRHQ149N8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SHPRHQ149N8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SHPRHQ149N8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SHPRHQ149N8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SHPRHQ149N8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SHPRHQ149N8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SHPRHQ149N8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SHPRHQ149N8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SHPRHQ149N8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SHPRHQ149N8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SHPRHQ149N8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SHPRHQ149N8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SHPRHQ149N8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
SHPRHQ149N8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SHPRHQ149N8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SHPRHQ149N8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SHPRHQ149N8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
SHPRHQ149N8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SHPRHQ149N8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SHPRHQ149N8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
SHPRHQ149N8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
SHPRHQ149N8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SHPRHQ149N8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SHPRHQ149N8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SHPRHQ149N8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SHPRHQ149N8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
SHPRHQ149N8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SHPRHQ149N8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SHPRHQ149N8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SHPRHQ149N8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SHPRHQ149N8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SHPRHQ149N8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
SHPRHQ149N8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SHPRHQ149N8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SHPRHQ149N8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SHPRHQ149N8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
SHPRHQ149N8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SHPRHQ149N8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SHPRHQ149N8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SHPRHQ149N8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
SHPRHQ149N8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SHPRHQ149N8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SHPRHQ149N8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SHPRHQ149N8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SHPRHQ149N8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SHPRHQ149N8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SHPRHQ149N8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SHPRHQ149N8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SHPRHQ149N8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SHPRHQ149N8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SHPRHQ149N8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SHPRHQ149N8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SHPRHQ149N8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SHPRHQ149N8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SHPRHQ149N8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SHPRHQ149N8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SHPRHQ149N8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SHPRHQ149N8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SHPRHQ149N8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SHPRHQ149N8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SHPRHQ149N8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SHPRHQ149N8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SHPRHQ149N8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SHPRHQ149N8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SHPRHQ149N8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SHPRHQ149N8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SHPRHQ149N8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SHPRHQ149N8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SHPRHQ149N8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SHPRHQ149N8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SHPRHQ149N8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SHPRHQ149N8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SHPRHQ149N8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SHPRHQ149N8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SHPRHQ149N8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SHPRHQ149N8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SHPRHQ149N8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
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