Protein–RNA interactions for Protein: Q14669

TRIP12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP12Q14669 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIP12Q14669 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIP12Q14669 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIP12Q14669 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIP12Q14669 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIP12Q14669 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIP12Q14669 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIP12Q14669 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TRIP12Q14669 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TRIP12Q14669 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIP12Q14669 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIP12Q14669 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIP12Q14669 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIP12Q14669 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIP12Q14669 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIP12Q14669 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIP12Q14669 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIP12Q14669 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIP12Q14669 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIP12Q14669 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIP12Q14669 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIP12Q14669 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIP12Q14669 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIP12Q14669 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIP12Q14669 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIP12Q14669 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIP12Q14669 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIP12Q14669 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIP12Q14669 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIP12Q14669 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIP12Q14669 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIP12Q14669 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIP12Q14669 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIP12Q14669 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIP12Q14669 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIP12Q14669 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIP12Q14669 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TRIP12Q14669 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIP12Q14669 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIP12Q14669 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIP12Q14669 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIP12Q14669 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIP12Q14669 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIP12Q14669 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIP12Q14669 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIP12Q14669 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIP12Q14669 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIP12Q14669 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIP12Q14669 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIP12Q14669 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIP12Q14669 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIP12Q14669 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIP12Q14669 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIP12Q14669 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIP12Q14669 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIP12Q14669 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIP12Q14669 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIP12Q14669 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIP12Q14669 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIP12Q14669 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIP12Q14669 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIP12Q14669 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIP12Q14669 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIP12Q14669 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIP12Q14669 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIP12Q14669 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIP12Q14669 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIP12Q14669 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIP12Q14669 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIP12Q14669 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIP12Q14669 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIP12Q14669 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIP12Q14669 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIP12Q14669 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIP12Q14669 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIP12Q14669 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIP12Q14669 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIP12Q14669 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIP12Q14669 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIP12Q14669 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIP12Q14669 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIP12Q14669 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIP12Q14669 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIP12Q14669 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIP12Q14669 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIP12Q14669 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIP12Q14669 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIP12Q14669 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIP12Q14669 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIP12Q14669 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIP12Q14669 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIP12Q14669 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIP12Q14669 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIP12Q14669 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIP12Q14669 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIP12Q14669 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIP12Q14669 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIP12Q14669 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIP12Q14669 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIP12Q14669 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms