Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBFBQ13951 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBFBQ13951 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CBFBQ13951 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBFBQ13951 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBFBQ13951 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBFBQ13951 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBFBQ13951 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBFBQ13951 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBFBQ13951 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBFBQ13951 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBFBQ13951 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBFBQ13951 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBFBQ13951 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBFBQ13951 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBFBQ13951 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBFBQ13951 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CBFBQ13951 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBFBQ13951 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBFBQ13951 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBFBQ13951 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBFBQ13951 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBFBQ13951 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CBFBQ13951 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBFBQ13951 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBFBQ13951 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBFBQ13951 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CBFBQ13951 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBFBQ13951 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBFBQ13951 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBFBQ13951 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBFBQ13951 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBFBQ13951 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBFBQ13951 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBFBQ13951 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBFBQ13951 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CBFBQ13951 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBFBQ13951 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBFBQ13951 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBFBQ13951 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBFBQ13951 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBFBQ13951 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBFBQ13951 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBFBQ13951 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBFBQ13951 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBFBQ13951 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBFBQ13951 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBFBQ13951 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBFBQ13951 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBFBQ13951 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBFBQ13951 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBFBQ13951 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBFBQ13951 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBFBQ13951 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBFBQ13951 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBFBQ13951 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBFBQ13951 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBFBQ13951 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBFBQ13951 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBFBQ13951 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBFBQ13951 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBFBQ13951 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBFBQ13951 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBFBQ13951 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBFBQ13951 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBFBQ13951 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBFBQ13951 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CBFBQ13951 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBFBQ13951 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBFBQ13951 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBFBQ13951 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBFBQ13951 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBFBQ13951 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBFBQ13951 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBFBQ13951 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CBFBQ13951 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CBFBQ13951 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBFBQ13951 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBFBQ13951 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBFBQ13951 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBFBQ13951 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CBFBQ13951 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CBFBQ13951 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CBFBQ13951 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CBFBQ13951 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBFBQ13951 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBFBQ13951 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CBFBQ13951 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBFBQ13951 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBFBQ13951 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBFBQ13951 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBFBQ13951 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBFBQ13951 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBFBQ13951 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBFBQ13951 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBFBQ13951 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CBFBQ13951 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBFBQ13951 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBFBQ13951 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBFBQ13951 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
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