Protein–RNA interactions for Protein: Q13641

TPBG, Trophoblast glycoprotein, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGQ13641 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPBGQ13641 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPBGQ13641 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPBGQ13641 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPBGQ13641 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPBGQ13641 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPBGQ13641 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPBGQ13641 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPBGQ13641 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPBGQ13641 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPBGQ13641 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPBGQ13641 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPBGQ13641 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPBGQ13641 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPBGQ13641 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPBGQ13641 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPBGQ13641 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPBGQ13641 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPBGQ13641 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPBGQ13641 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPBGQ13641 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPBGQ13641 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPBGQ13641 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPBGQ13641 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPBGQ13641 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPBGQ13641 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPBGQ13641 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPBGQ13641 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPBGQ13641 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPBGQ13641 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPBGQ13641 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPBGQ13641 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPBGQ13641 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPBGQ13641 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPBGQ13641 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPBGQ13641 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPBGQ13641 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPBGQ13641 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPBGQ13641 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPBGQ13641 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPBGQ13641 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPBGQ13641 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPBGQ13641 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPBGQ13641 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPBGQ13641 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPBGQ13641 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TPBGQ13641 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPBGQ13641 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPBGQ13641 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPBGQ13641 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPBGQ13641 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPBGQ13641 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPBGQ13641 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPBGQ13641 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPBGQ13641 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPBGQ13641 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPBGQ13641 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPBGQ13641 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPBGQ13641 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPBGQ13641 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPBGQ13641 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPBGQ13641 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPBGQ13641 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPBGQ13641 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TPBGQ13641 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPBGQ13641 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TPBGQ13641 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPBGQ13641 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPBGQ13641 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPBGQ13641 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPBGQ13641 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPBGQ13641 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPBGQ13641 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPBGQ13641 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TPBGQ13641 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPBGQ13641 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPBGQ13641 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPBGQ13641 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPBGQ13641 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPBGQ13641 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPBGQ13641 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPBGQ13641 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPBGQ13641 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPBGQ13641 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPBGQ13641 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TPBGQ13641 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TPBGQ13641 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPBGQ13641 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPBGQ13641 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPBGQ13641 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPBGQ13641 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPBGQ13641 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPBGQ13641 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPBGQ13641 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPBGQ13641 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPBGQ13641 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPBGQ13641 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TPBGQ13641 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TPBGQ13641 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPBGQ13641 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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