Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NAE1Q13564 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NAE1Q13564 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NAE1Q13564 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAE1Q13564 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAE1Q13564 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAE1Q13564 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAE1Q13564 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAE1Q13564 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAE1Q13564 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAE1Q13564 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NAE1Q13564 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NAE1Q13564 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NAE1Q13564 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NAE1Q13564 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NAE1Q13564 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NAE1Q13564 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NAE1Q13564 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NAE1Q13564 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NAE1Q13564 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NAE1Q13564 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NAE1Q13564 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NAE1Q13564 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NAE1Q13564 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NAE1Q13564 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NAE1Q13564 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NAE1Q13564 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAE1Q13564 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAE1Q13564 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAE1Q13564 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAE1Q13564 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAE1Q13564 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAE1Q13564 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NAE1Q13564 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NAE1Q13564 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NAE1Q13564 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NAE1Q13564 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NAE1Q13564 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NAE1Q13564 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NAE1Q13564 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NAE1Q13564 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NAE1Q13564 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NAE1Q13564 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NAE1Q13564 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NAE1Q13564 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NAE1Q13564 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NAE1Q13564 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NAE1Q13564 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NAE1Q13564 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NAE1Q13564 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NAE1Q13564 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NAE1Q13564 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NAE1Q13564 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NAE1Q13564 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NAE1Q13564 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NAE1Q13564 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NAE1Q13564 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NAE1Q13564 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NAE1Q13564 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NAE1Q13564 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NAE1Q13564 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NAE1Q13564 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NAE1Q13564 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NAE1Q13564 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NAE1Q13564 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NAE1Q13564 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NAE1Q13564 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NAE1Q13564 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NAE1Q13564 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NAE1Q13564 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NAE1Q13564 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NAE1Q13564 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NAE1Q13564 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NAE1Q13564 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NAE1Q13564 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NAE1Q13564 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NAE1Q13564 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NAE1Q13564 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NAE1Q13564 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NAE1Q13564 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NAE1Q13564 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NAE1Q13564 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAE1Q13564 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAE1Q13564 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAE1Q13564 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAE1Q13564 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAE1Q13564 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NAE1Q13564 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NAE1Q13564 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NAE1Q13564 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NAE1Q13564 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NAE1Q13564 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NAE1Q13564 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NAE1Q13564 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAE1Q13564 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAE1Q13564 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NAE1Q13564 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAE1Q13564 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAE1Q13564 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NAE1Q13564 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
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