Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PICALMQ13492 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
PICALMQ13492 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PICALMQ13492 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PICALMQ13492 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PICALMQ13492 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PICALMQ13492 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PICALMQ13492 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PICALMQ13492 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PICALMQ13492 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PICALMQ13492 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PICALMQ13492 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PICALMQ13492 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
PICALMQ13492 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PICALMQ13492 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
PICALMQ13492 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
PICALMQ13492 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PICALMQ13492 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PICALMQ13492 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PICALMQ13492 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PICALMQ13492 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PICALMQ13492 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PICALMQ13492 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PICALMQ13492 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PICALMQ13492 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PICALMQ13492 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PICALMQ13492 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
PICALMQ13492 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PICALMQ13492 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PICALMQ13492 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PICALMQ13492 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PICALMQ13492 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PICALMQ13492 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PICALMQ13492 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PICALMQ13492 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PICALMQ13492 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PICALMQ13492 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PICALMQ13492 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PICALMQ13492 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PICALMQ13492 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PICALMQ13492 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PICALMQ13492 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
PICALMQ13492 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PICALMQ13492 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PICALMQ13492 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PICALMQ13492 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PICALMQ13492 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PICALMQ13492 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PICALMQ13492 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PICALMQ13492 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PICALMQ13492 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PICALMQ13492 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PICALMQ13492 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PICALMQ13492 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PICALMQ13492 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PICALMQ13492 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PICALMQ13492 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PICALMQ13492 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PICALMQ13492 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PICALMQ13492 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PICALMQ13492 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PICALMQ13492 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PICALMQ13492 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PICALMQ13492 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PICALMQ13492 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PICALMQ13492 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PICALMQ13492 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PICALMQ13492 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PICALMQ13492 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PICALMQ13492 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PICALMQ13492 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PICALMQ13492 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
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