Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTGDRQ13258 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTGDRQ13258 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTGDRQ13258 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTGDRQ13258 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTGDRQ13258 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTGDRQ13258 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTGDRQ13258 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTGDRQ13258 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTGDRQ13258 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTGDRQ13258 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PTGDRQ13258 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTGDRQ13258 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PTGDRQ13258 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTGDRQ13258 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTGDRQ13258 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTGDRQ13258 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTGDRQ13258 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTGDRQ13258 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTGDRQ13258 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTGDRQ13258 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTGDRQ13258 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTGDRQ13258 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTGDRQ13258 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTGDRQ13258 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTGDRQ13258 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTGDRQ13258 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTGDRQ13258 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTGDRQ13258 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTGDRQ13258 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTGDRQ13258 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PTGDRQ13258 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTGDRQ13258 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTGDRQ13258 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTGDRQ13258 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTGDRQ13258 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTGDRQ13258 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTGDRQ13258 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTGDRQ13258 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTGDRQ13258 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTGDRQ13258 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTGDRQ13258 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTGDRQ13258 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTGDRQ13258 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTGDRQ13258 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTGDRQ13258 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PTGDRQ13258 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTGDRQ13258 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTGDRQ13258 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTGDRQ13258 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTGDRQ13258 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTGDRQ13258 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTGDRQ13258 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PTGDRQ13258 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTGDRQ13258 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTGDRQ13258 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTGDRQ13258 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTGDRQ13258 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTGDRQ13258 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTGDRQ13258 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTGDRQ13258 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTGDRQ13258 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTGDRQ13258 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTGDRQ13258 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTGDRQ13258 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTGDRQ13258 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTGDRQ13258 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTGDRQ13258 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTGDRQ13258 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTGDRQ13258 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTGDRQ13258 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTGDRQ13258 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTGDRQ13258 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTGDRQ13258 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTGDRQ13258 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTGDRQ13258 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PTGDRQ13258 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTGDRQ13258 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTGDRQ13258 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PTGDRQ13258 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTGDRQ13258 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTGDRQ13258 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTGDRQ13258 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PTGDRQ13258 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTGDRQ13258 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTGDRQ13258 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTGDRQ13258 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTGDRQ13258 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTGDRQ13258 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTGDRQ13258 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTGDRQ13258 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTGDRQ13258 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTGDRQ13258 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTGDRQ13258 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTGDRQ13258 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTGDRQ13258 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTGDRQ13258 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTGDRQ13258 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTGDRQ13258 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTGDRQ13258 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
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