Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPFIA1Q13136 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPFIA1Q13136 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPFIA1Q13136 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPFIA1Q13136 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPFIA1Q13136 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPFIA1Q13136 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPFIA1Q13136 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPFIA1Q13136 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPFIA1Q13136 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPFIA1Q13136 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPFIA1Q13136 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPFIA1Q13136 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPFIA1Q13136 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPFIA1Q13136 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPFIA1Q13136 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPFIA1Q13136 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPFIA1Q13136 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPFIA1Q13136 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPFIA1Q13136 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPFIA1Q13136 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PPFIA1Q13136 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPFIA1Q13136 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPFIA1Q13136 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPFIA1Q13136 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPFIA1Q13136 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPFIA1Q13136 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPFIA1Q13136 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPFIA1Q13136 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPFIA1Q13136 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PPFIA1Q13136 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PPFIA1Q13136 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PPFIA1Q13136 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPFIA1Q13136 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPFIA1Q13136 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPFIA1Q13136 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPFIA1Q13136 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPFIA1Q13136 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPFIA1Q13136 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPFIA1Q13136 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPFIA1Q13136 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPFIA1Q13136 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPFIA1Q13136 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPFIA1Q13136 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPFIA1Q13136 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPFIA1Q13136 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPFIA1Q13136 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPFIA1Q13136 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPFIA1Q13136 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPFIA1Q13136 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PPFIA1Q13136 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPFIA1Q13136 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPFIA1Q13136 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPFIA1Q13136 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPFIA1Q13136 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPFIA1Q13136 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PPFIA1Q13136 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PPFIA1Q13136 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PPFIA1Q13136 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPFIA1Q13136 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPFIA1Q13136 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPFIA1Q13136 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPFIA1Q13136 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPFIA1Q13136 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPFIA1Q13136 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPFIA1Q13136 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PPFIA1Q13136 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PPFIA1Q13136 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPFIA1Q13136 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPFIA1Q13136 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPFIA1Q13136 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPFIA1Q13136 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPFIA1Q13136 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPFIA1Q13136 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PPFIA1Q13136 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PPFIA1Q13136 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPFIA1Q13136 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPFIA1Q13136 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPFIA1Q13136 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPFIA1Q13136 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPFIA1Q13136 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PPFIA1Q13136 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPFIA1Q13136 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPFIA1Q13136 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPFIA1Q13136 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPFIA1Q13136 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPFIA1Q13136 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPFIA1Q13136 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPFIA1Q13136 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPFIA1Q13136 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PPFIA1Q13136 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPFIA1Q13136 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPFIA1Q13136 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPFIA1Q13136 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPFIA1Q13136 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPFIA1Q13136 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPFIA1Q13136 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPFIA1Q13136 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPFIA1Q13136 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PPFIA1Q13136 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
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