Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
RLFQ13129 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
RLFQ13129 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RLFQ13129 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RLFQ13129 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RLFQ13129 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RLFQ13129 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RLFQ13129 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RLFQ13129 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RLFQ13129 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RLFQ13129 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RLFQ13129 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RLFQ13129 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RLFQ13129 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RLFQ13129 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RLFQ13129 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RLFQ13129 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RLFQ13129 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RLFQ13129 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RLFQ13129 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
RLFQ13129 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RLFQ13129 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RLFQ13129 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RLFQ13129 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RLFQ13129 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RLFQ13129 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RLFQ13129 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RLFQ13129 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RLFQ13129 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RLFQ13129 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RLFQ13129 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RLFQ13129 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RLFQ13129 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RLFQ13129 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RLFQ13129 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RLFQ13129 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RLFQ13129 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RLFQ13129 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RLFQ13129 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RLFQ13129 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RLFQ13129 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RLFQ13129 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RLFQ13129 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RLFQ13129 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RLFQ13129 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RLFQ13129 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RLFQ13129 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RLFQ13129 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
RLFQ13129 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
RLFQ13129 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
RLFQ13129 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
RLFQ13129 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
RLFQ13129 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
RLFQ13129 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
RLFQ13129 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
RLFQ13129 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
RLFQ13129 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RLFQ13129 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RLFQ13129 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RLFQ13129 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RLFQ13129 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RLFQ13129 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RLFQ13129 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RLFQ13129 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
RLFQ13129 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RLFQ13129 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RLFQ13129 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
RLFQ13129 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RLFQ13129 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RLFQ13129 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RLFQ13129 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RLFQ13129 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RLFQ13129 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RLFQ13129 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
RLFQ13129 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RLFQ13129 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RLFQ13129 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RLFQ13129 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RLFQ13129 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RLFQ13129 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RLFQ13129 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RLFQ13129 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RLFQ13129 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RLFQ13129 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RLFQ13129 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RLFQ13129 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RLFQ13129 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RLFQ13129 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RLFQ13129 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RLFQ13129 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RLFQ13129 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RLFQ13129 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RLFQ13129 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RLFQ13129 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RLFQ13129 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RLFQ13129 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RLFQ13129 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RLFQ13129 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
RLFQ13129 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
RLFQ13129 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
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