Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MKRN3Q13064 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MKRN3Q13064 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MKRN3Q13064 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MKRN3Q13064 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MKRN3Q13064 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MKRN3Q13064 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MKRN3Q13064 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
MKRN3Q13064 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
MKRN3Q13064 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
MKRN3Q13064 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
MKRN3Q13064 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
MKRN3Q13064 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
MKRN3Q13064 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MKRN3Q13064 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MKRN3Q13064 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MKRN3Q13064 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MKRN3Q13064 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MKRN3Q13064 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MKRN3Q13064 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MKRN3Q13064 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MKRN3Q13064 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
MKRN3Q13064 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
MKRN3Q13064 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MKRN3Q13064 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MKRN3Q13064 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
MKRN3Q13064 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
MKRN3Q13064 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
MKRN3Q13064 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
MKRN3Q13064 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
MKRN3Q13064 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
MKRN3Q13064 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.16■■■□□ 2.58
MKRN3Q13064 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
MKRN3Q13064 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
MKRN3Q13064 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
MKRN3Q13064 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MKRN3Q13064 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MKRN3Q13064 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MKRN3Q13064 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
MKRN3Q13064 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MKRN3Q13064 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MKRN3Q13064 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MKRN3Q13064 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
MKRN3Q13064 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
MKRN3Q13064 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
MKRN3Q13064 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
MKRN3Q13064 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
MKRN3Q13064 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
MKRN3Q13064 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
MKRN3Q13064 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
MKRN3Q13064 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
MKRN3Q13064 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
MKRN3Q13064 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
MKRN3Q13064 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
MKRN3Q13064 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
MKRN3Q13064 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
MKRN3Q13064 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
MKRN3Q13064 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
MKRN3Q13064 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
MKRN3Q13064 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
MKRN3Q13064 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MKRN3Q13064 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
MKRN3Q13064 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
MKRN3Q13064 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
MKRN3Q13064 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
MKRN3Q13064 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
MKRN3Q13064 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
MKRN3Q13064 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
MKRN3Q13064 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MKRN3Q13064 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MKRN3Q13064 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MKRN3Q13064 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MKRN3Q13064 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
MKRN3Q13064 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
MKRN3Q13064 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MKRN3Q13064 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
MKRN3Q13064 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
MKRN3Q13064 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MKRN3Q13064 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
MKRN3Q13064 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MKRN3Q13064 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MKRN3Q13064 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MKRN3Q13064 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
MKRN3Q13064 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
MKRN3Q13064 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
MKRN3Q13064 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
MKRN3Q13064 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MKRN3Q13064 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
MKRN3Q13064 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
MKRN3Q13064 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
MKRN3Q13064 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MKRN3Q13064 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
MKRN3Q13064 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
MKRN3Q13064 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
MKRN3Q13064 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MKRN3Q13064 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MKRN3Q13064 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
MKRN3Q13064 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
MKRN3Q13064 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
MKRN3Q13064 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
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