Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 MHF1YOL086W-A 273 nt8.91□□□□□ -0.98
LDB17Q12342 IML3YBR107C 738 nt8.91□□□□□ -0.98
LDB17Q12342 CTI6YPL181W 1521 nt8.9□□□□□ -0.98
LDB17Q12342 GID8YMR135C 1368 nt8.89□□□□□ -0.99
LDB17Q12342 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.89□□□□□ -0.99
LDB17Q12342 YLR046CYLR046C 813 nt8.89□□□□□ -0.99
LDB17Q12342 DLD3YEL071W 1491 nt8.88□□□□□ -0.99
LDB17Q12342 TAF13YML098W 504 nt8.87□□□□□ -0.99
LDB17Q12342 YHR219WYHR219W 1875 nt8.86□□□□□ -0.99
LDB17Q12342 ADH7YCR105W 1086 nt8.86□□□□□ -0.99
LDB17Q12342 ADE8YDR408C 645 nt8.86□□□□□ -0.99
LDB17Q12342 MRS6YOR370C 1812 nt8.86□□□□□ -0.99
LDB17Q12342 SPS100YHR139C 981 nt8.85□□□□□ -0.99
LDB17Q12342 YJR114WYJR114W 393 nt8.85□□□□□ -0.99
LDB17Q12342 ODC1YPL134C 933 nt8.85□□□□□ -0.99
LDB17Q12342 SSL2YIL143C 2532 nt8.85□□□□□ -0.99
LDB17Q12342 TVP23YDR084C 600 nt8.84□□□□□ -0.99
LDB17Q12342 PSD1YNL169C 1503 nt8.84□□□□□ -0.99
LDB17Q12342 ITR2YOL103W 1830 nt8.83□□□□□ -1
LDB17Q12342 POT1YIL160C 1254 nt8.83□□□□□ -1
LDB17Q12342 PAU15YIR041W 375 nt8.83□□□□□ -1
LDB17Q12342 OPI3YJR073C 621 nt8.83□□□□□ -1
LDB17Q12342 YKL133CYKL133C 1392 nt8.83□□□□□ -1
LDB17Q12342 YHL008CYHL008C 1884 nt8.83□□□□□ -1
LDB17Q12342 DMA2YNL116W 1569 nt8.82□□□□□ -1
LDB17Q12342 HMG2YLR450W 3138 nt8.81□□□□□ -1
LDB17Q12342 YMR262WYMR262W 942 nt8.8□□□□□ -1
LDB17Q12342 TPO4YOR273C 1980 nt8.79□□□□□ -1
LDB17Q12342 YNR064CYNR064C 873 nt8.78□□□□□ -1
LDB17Q12342 NIF3YGL221C 867 nt8.77□□□□□ -1.01
LDB17Q12342 CWP2YKL096W-A 279 nt8.77□□□□□ -1.01
LDB17Q12342 GSF2YML048W 1212 nt8.77□□□□□ -1.01
LDB17Q12342 TUB4YLR212C 1422 nt8.77□□□□□ -1.01
LDB17Q12342 DTR1YBR180W 1719 nt8.77□□□□□ -1.01
LDB17Q12342 ESS1YJR017C 513 nt8.76□□□□□ -1.01
LDB17Q12342 LSR1LSR1 1175 nt8.76□□□□□ -1.01
LDB17Q12342 ABZ2YMR289W 1125 nt8.75□□□□□ -1.01
LDB17Q12342 CYT1YOR065W 930 nt8.75□□□□□ -1.01
LDB17Q12342 PGC1YPL206C 966 nt8.75□□□□□ -1.01
LDB17Q12342 VMA11YPL234C 495 nt8.75□□□□□ -1.01
LDB17Q12342 YHR218WYHR218W 1812 nt8.75□□□□□ -1.01
LDB17Q12342 APS2YJR058C 444 nt8.73□□□□□ -1.01
LDB17Q12342 RPD3YNL330C 1302 nt8.73□□□□□ -1.01
LDB17Q12342 HEM14YER014W 1620 nt8.72□□□□□ -1.01
LDB17Q12342 KEL3YPL263C 1956 nt8.72□□□□□ -1.01
LDB17Q12342 PAU5YFL020C 369 nt8.72□□□□□ -1.01
LDB17Q12342 ELO1YJL196C 933 nt8.72□□□□□ -1.01
LDB17Q12342 MDM35YKL053C-A 261 nt8.72□□□□□ -1.01
LDB17Q12342 STP3YLR375W 1032 nt8.72□□□□□ -1.01
LDB17Q12342 ILV2YMR108W 2064 nt8.72□□□□□ -1.01
LDB17Q12342 SUV3YPL029W 2214 nt8.71□□□□□ -1.02
LDB17Q12342 YRF1-2YER190W 5046 nt8.71□□□□□ -1.02
LDB17Q12342 YMR265CYMR265C 1386 nt8.71□□□□□ -1.02
LDB17Q12342 SWT21YNL187W 1074 nt8.7□□□□□ -1.02
LDB17Q12342 YBR232CYBR232C 360 nt8.7□□□□□ -1.02
LDB17Q12342 SFL1YOR140W 2301 nt8.7□□□□□ -1.02
LDB17Q12342 PCP1YGR101W 1041 nt8.69□□□□□ -1.02
LDB17Q12342 RFC1YOR217W 2586 nt8.69□□□□□ -1.02
LDB17Q12342 KRR1YCL059C 951 nt8.68□□□□□ -1.02
LDB17Q12342 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt8.68□□□□□ -1.02
LDB17Q12342 HAP5YOR358W 729 nt8.68□□□□□ -1.02
LDB17Q12342 TIP1YBR067C 633 nt8.68□□□□□ -1.02
LDB17Q12342 AMF1YOR378W 1548 nt8.68□□□□□ -1.02
LDB17Q12342 SNX3YOR357C 489 nt8.67□□□□□ -1.02
LDB17Q12342 HXT10YFL011W 1641 nt8.65□□□□□ -1.02
LDB17Q12342 CDD1YLR245C 429 nt8.65□□□□□ -1.02
LDB17Q12342 MCM5YLR274W 2328 nt8.64□□□□□ -1.03
LDB17Q12342 PAR32YDL173W 888 nt8.64□□□□□ -1.03
LDB17Q12342 RPN14YGL004C 1254 nt8.64□□□□□ -1.03
LDB17Q12342 TIM44YIL022W 1296 nt8.64□□□□□ -1.03
LDB17Q12342 snR31snR31 225 nt8.64□□□□□ -1.03
LDB17Q12342 MET1YKR069W 1782 nt8.63□□□□□ -1.03
LDB17Q12342 ENO2YHR174W 1314 nt8.62□□□□□ -1.03
LDB17Q12342 NAS2YIL007C 663 nt8.62□□□□□ -1.03
LDB17Q12342 RPC31YNL151C 756 nt8.62□□□□□ -1.03
LDB17Q12342 CRC1YOR100C 984 nt8.62□□□□□ -1.03
LDB17Q12342 TPC1YGR096W 945 nt8.6□□□□□ -1.03
LDB17Q12342 RIM2YBR192W 1134 nt8.6□□□□□ -1.03
LDB17Q12342 THP3YPR045C 1413 nt8.6□□□□□ -1.03
LDB17Q12342 DPL1YDR294C 1770 nt8.6□□□□□ -1.03
LDB17Q12342 FSH2YMR222C 672 nt8.59□□□□□ -1.03
LDB17Q12342 LEU2YCL018W 1095 nt8.59□□□□□ -1.03
LDB17Q12342 HXK1YFR053C 1458 nt8.58□□□□□ -1.04
LDB17Q12342 URA8YJR103W 1737 nt8.58□□□□□ -1.04
LDB17Q12342 IGD1YFR017C 588 nt8.58□□□□□ -1.04
LDB17Q12342 ALD5YER073W 1563 nt8.57□□□□□ -1.04
LDB17Q12342 AGP3YFL055W 1677 nt8.57□□□□□ -1.04
LDB17Q12342 GTB1YDR221W 2109 nt8.57□□□□□ -1.04
LDB17Q12342 YKL053WYKL053W 375 nt8.56□□□□□ -1.04
LDB17Q12342 SAN1YDR143C 1833 nt8.54□□□□□ -1.04
LDB17Q12342 NAM8YHR086W 1572 nt8.54□□□□□ -1.04
LDB17Q12342 MAS1YLR163C 1389 nt8.54□□□□□ -1.04
LDB17Q12342 SEN2YLR105C 1134 nt8.54□□□□□ -1.04
LDB17Q12342 RSC4YKR008W 1878 nt8.53□□□□□ -1.04
LDB17Q12342 SPE2YOL052C 1191 nt8.53□□□□□ -1.04
LDB17Q12342 KGD2YDR148C 1392 nt8.52□□□□□ -1.05
LDB17Q12342 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.52□□□□□ -1.05
LDB17Q12342 KRE1YNL322C 942 nt8.52□□□□□ -1.05
LDB17Q12342 PHB2YGR231C 933 nt8.49□□□□□ -1.05
LDB17Q12342 YJL064WYJL064W 396 nt8.49□□□□□ -1.05
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