Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 MHO1YJR008W 1017 nt9.96□□□□□ -0.82
TFB4Q12004 DBR1YKL149C 1218 nt9.96□□□□□ -0.82
TFB4Q12004 RSF1YMR030W 1131 nt9.96□□□□□ -0.82
TFB4Q12004 SPC24YMR117C 642 nt9.96□□□□□ -0.82
TFB4Q12004 RFC1YOR217W 2586 nt9.95□□□□□ -0.82
TFB4Q12004 YLR198CYLR198C 360 nt9.95□□□□□ -0.82
TFB4Q12004 YMR226CYMR226C 804 nt9.95□□□□□ -0.82
TFB4Q12004 FES1YBR101C 873 nt9.95□□□□□ -0.82
TFB4Q12004 RTG3YBL103C 1461 nt9.95□□□□□ -0.82
TFB4Q12004 HAS1YMR290C 1518 nt9.95□□□□□ -0.82
TFB4Q12004 AVT6YER119C 1347 nt9.94□□□□□ -0.82
TFB4Q12004 HMG2YLR450W 3138 nt9.94□□□□□ -0.82
TFB4Q12004 ISR1YPR106W 1332 nt9.93□□□□□ -0.82
TFB4Q12004 FSH1YHR049W 732 nt9.93□□□□□ -0.82
TFB4Q12004 HAT1YPL001W 1125 nt9.93□□□□□ -0.82
TFB4Q12004 FUR4YBR021W 1902 nt9.93□□□□□ -0.82
TFB4Q12004 YCR102CYCR102C 1107 nt9.91□□□□□ -0.82
TFB4Q12004 GOR1YNL274C 1053 nt9.91□□□□□ -0.82
TFB4Q12004 OAZ1YPL052W 879 nt9.91□□□□□ -0.82
TFB4Q12004 CCA1YER168C 1641 nt9.9□□□□□ -0.82
TFB4Q12004 JJJ3YJR097W 519 nt9.9□□□□□ -0.82
TFB4Q12004 RCE1YMR274C 948 nt9.9□□□□□ -0.82
TFB4Q12004 TFB4YPR056W 1017 nt9.9□□□□□ -0.82
TFB4Q12004 MRP20YDR405W 792 nt9.89□□□□□ -0.83
TFB4Q12004 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt9.89□□□□□ -0.83
TFB4Q12004 IDP3YNL009W 1263 nt9.89□□□□□ -0.83
TFB4Q12004 RRP40YOL142W 723 nt9.89□□□□□ -0.83
TFB4Q12004 POS5YPL188W 1245 nt9.89□□□□□ -0.83
TFB4Q12004 ARR1YPR199C 885 nt9.89□□□□□ -0.83
TFB4Q12004 YGR168CYGR168C 1131 nt9.88□□□□□ -0.83
TFB4Q12004 MER1YNL210W 813 nt9.88□□□□□ -0.83
TFB4Q12004 NPL6YMR091C 1308 nt9.87□□□□□ -0.83
TFB4Q12004 COS6YGR295C 1146 nt9.87□□□□□ -0.83
TFB4Q12004 COQ2YNR041C 1119 nt9.87□□□□□ -0.83
TFB4Q12004 TSR3YOR006C 942 nt9.87□□□□□ -0.83
TFB4Q12004 ATG22YCL038C 1587 nt9.87□□□□□ -0.83
TFB4Q12004 ELO1YJL196C 933 nt9.86□□□□□ -0.83
TFB4Q12004 RRS1YOR294W 612 nt9.86□□□□□ -0.83
TFB4Q12004 UBS1YBR165W 834 nt9.86□□□□□ -0.83
TFB4Q12004 SFA1YDL168W 1161 nt9.85□□□□□ -0.83
TFB4Q12004 MAD2YJL030W 591 nt9.85□□□□□ -0.83
TFB4Q12004 MRPL24YMR193W 777 nt9.85□□□□□ -0.83
TFB4Q12004 LSB5YCL034W 1065 nt9.85□□□□□ -0.83
TFB4Q12004 PRP4YPR178W 1398 nt9.85□□□□□ -0.83
TFB4Q12004 TPO4YOR273C 1980 nt9.84□□□□□ -0.83
TFB4Q12004 EDC1YGL222C 528 nt9.84□□□□□ -0.83
TFB4Q12004 OMA1YKR087C 1038 nt9.84□□□□□ -0.83
TFB4Q12004 BMT6YLR063W 1098 nt9.84□□□□□ -0.83
TFB4Q12004 CLB5YPR120C 1308 nt9.83□□□□□ -0.84
TFB4Q12004 YBR292CYBR292C 372 nt9.83□□□□□ -0.84
TFB4Q12004 AGP1YCL025C 1902 nt9.83□□□□□ -0.84
TFB4Q12004 MGR3YMR115W 1506 nt9.82□□□□□ -0.84
TFB4Q12004 TRP4YDR354W 1143 nt9.82□□□□□ -0.84
TFB4Q12004 PCL6YER059W 1263 nt9.82□□□□□ -0.84
TFB4Q12004 SUT1YGL162W 900 nt9.82□□□□□ -0.84
TFB4Q12004 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt9.82□□□□□ -0.84
TFB4Q12004 CUS2YNL286W 858 nt9.82□□□□□ -0.84
TFB4Q12004 RPL4BYDR012W 1089 nt9.81□□□□□ -0.84
TFB4Q12004 KRE28YDR532C 1158 nt9.81□□□□□ -0.84
TFB4Q12004 DAL2YIR029W 1032 nt9.81□□□□□ -0.84
TFB4Q12004 CTK2YJL006C 972 nt9.81□□□□□ -0.84
TFB4Q12004 DUS1YML080W 1272 nt9.81□□□□□ -0.84
TFB4Q12004 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt9.81□□□□□ -0.84
TFB4Q12004 RPL4AYBR031W 1089 nt9.81□□□□□ -0.84
TFB4Q12004 PBP1YGR178C 2169 nt9.8□□□□□ -0.84
TFB4Q12004 AAC1YMR056C 930 nt9.8□□□□□ -0.84
TFB4Q12004 GTB1YDR221W 2109 nt9.8□□□□□ -0.84
TFB4Q12004 YIF1YNL263C 945 nt9.79□□□□□ -0.84
TFB4Q12004 ILV2YMR108W 2064 nt9.78□□□□□ -0.84
TFB4Q12004 NBP35YGL091C 987 nt9.78□□□□□ -0.84
TFB4Q12004 SKI6YGR195W 741 nt9.78□□□□□ -0.84
TFB4Q12004 TIR3YIL011W 810 nt9.78□□□□□ -0.84
TFB4Q12004 DUT1YBR252W 444 nt9.78□□□□□ -0.84
TFB4Q12004 BSP1YPR171W 1731 nt9.78□□□□□ -0.84
TFB4Q12004 RRP17YDR412W 708 nt9.77□□□□□ -0.85
TFB4Q12004 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.77□□□□□ -0.85
TFB4Q12004 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt9.77□□□□□ -0.85
TFB4Q12004 ERV41YML067C 1059 nt9.77□□□□□ -0.85
TFB4Q12004 VPS20YMR077C 666 nt9.77□□□□□ -0.85
TFB4Q12004 SPR1YOR190W 1338 nt9.77□□□□□ -0.85
TFB4Q12004 PCL1YNL289W 840 nt9.76□□□□□ -0.85
TFB4Q12004 BTS1YPL069C 1008 nt9.76□□□□□ -0.85
TFB4Q12004 DPS1YLL018C 1674 nt9.76□□□□□ -0.85
TFB4Q12004 YLR111WYLR111W 333 nt9.75□□□□□ -0.85
TFB4Q12004 SAM1YLR180W 1149 nt9.75□□□□□ -0.85
TFB4Q12004 MRPS8YMR158W 468 nt9.75□□□□□ -0.85
TFB4Q12004 YHR145CYHR145C 357 nt9.74□□□□□ -0.85
TFB4Q12004 RPS14BYJL191W 417 nt9.74□□□□□ -0.85
TFB4Q12004 CYT2YKL087C 675 nt9.74□□□□□ -0.85
TFB4Q12004 ADD66YKL206C 804 nt9.74□□□□□ -0.85
TFB4Q12004 YAP7YOL028C 738 nt9.74□□□□□ -0.85
TFB4Q12004 YOL079WYOL079W 399 nt9.74□□□□□ -0.85
TFB4Q12004 RPF2YKR081C 1035 nt9.73□□□□□ -0.85
TFB4Q12004 LIP1YMR298W 453 nt9.73□□□□□ -0.85
TFB4Q12004 RAD17YOR368W 1206 nt9.73□□□□□ -0.85
TFB4Q12004 MAE1YKL029C 2010 nt9.72□□□□□ -0.85
TFB4Q12004 YCL074WYCL074W 927 nt9.72□□□□□ -0.85
TFB4Q12004 HMRA1YCR097W 381 nt9.72□□□□□ -0.85
TFB4Q12004 YEA4YEL004W 1029 nt9.72□□□□□ -0.85
TFB4Q12004 SLM4YBR077C 489 nt9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms