Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPPLY1Q0D2K3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPPLY1Q0D2K3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPPLY1Q0D2K3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPPLY1Q0D2K3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPPLY1Q0D2K3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPPLY1Q0D2K3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPPLY1Q0D2K3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPPLY1Q0D2K3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPPLY1Q0D2K3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPPLY1Q0D2K3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPPLY1Q0D2K3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPPLY1Q0D2K3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPPLY1Q0D2K3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPPLY1Q0D2K3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPPLY1Q0D2K3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPPLY1Q0D2K3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPPLY1Q0D2K3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RIPPLY1Q0D2K3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPPLY1Q0D2K3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPPLY1Q0D2K3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPPLY1Q0D2K3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPPLY1Q0D2K3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPPLY1Q0D2K3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPPLY1Q0D2K3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPPLY1Q0D2K3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPPLY1Q0D2K3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPPLY1Q0D2K3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPPLY1Q0D2K3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPPLY1Q0D2K3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPPLY1Q0D2K3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPPLY1Q0D2K3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPPLY1Q0D2K3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPPLY1Q0D2K3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPPLY1Q0D2K3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPPLY1Q0D2K3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPPLY1Q0D2K3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPPLY1Q0D2K3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPPLY1Q0D2K3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RIPPLY1Q0D2K3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPPLY1Q0D2K3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPPLY1Q0D2K3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPPLY1Q0D2K3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPPLY1Q0D2K3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPPLY1Q0D2K3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPPLY1Q0D2K3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPPLY1Q0D2K3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPPLY1Q0D2K3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPPLY1Q0D2K3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPPLY1Q0D2K3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPPLY1Q0D2K3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPPLY1Q0D2K3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPPLY1Q0D2K3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPPLY1Q0D2K3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPPLY1Q0D2K3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPPLY1Q0D2K3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPPLY1Q0D2K3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPPLY1Q0D2K3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPPLY1Q0D2K3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPPLY1Q0D2K3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPPLY1Q0D2K3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIPPLY1Q0D2K3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPPLY1Q0D2K3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPPLY1Q0D2K3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPPLY1Q0D2K3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPPLY1Q0D2K3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPPLY1Q0D2K3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPPLY1Q0D2K3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPPLY1Q0D2K3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPPLY1Q0D2K3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPPLY1Q0D2K3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPPLY1Q0D2K3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPPLY1Q0D2K3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPPLY1Q0D2K3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPPLY1Q0D2K3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPPLY1Q0D2K3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPPLY1Q0D2K3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPPLY1Q0D2K3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIPPLY1Q0D2K3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RIPPLY1Q0D2K3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIPPLY1Q0D2K3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPPLY1Q0D2K3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPPLY1Q0D2K3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPPLY1Q0D2K3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPPLY1Q0D2K3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPPLY1Q0D2K3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPPLY1Q0D2K3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPPLY1Q0D2K3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms