Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM27E3Q08E93 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM27E3Q08E93 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM27E3Q08E93 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM27E3Q08E93 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM27E3Q08E93 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM27E3Q08E93 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM27E3Q08E93 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM27E3Q08E93 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM27E3Q08E93 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM27E3Q08E93 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM27E3Q08E93 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM27E3Q08E93 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM27E3Q08E93 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM27E3Q08E93 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM27E3Q08E93 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM27E3Q08E93 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM27E3Q08E93 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM27E3Q08E93 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM27E3Q08E93 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM27E3Q08E93 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM27E3Q08E93 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM27E3Q08E93 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM27E3Q08E93 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM27E3Q08E93 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM27E3Q08E93 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM27E3Q08E93 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM27E3Q08E93 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM27E3Q08E93 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM27E3Q08E93 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM27E3Q08E93 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM27E3Q08E93 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM27E3Q08E93 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM27E3Q08E93 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM27E3Q08E93 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM27E3Q08E93 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM27E3Q08E93 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM27E3Q08E93 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM27E3Q08E93 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM27E3Q08E93 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM27E3Q08E93 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM27E3Q08E93 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM27E3Q08E93 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM27E3Q08E93 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM27E3Q08E93 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM27E3Q08E93 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM27E3Q08E93 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM27E3Q08E93 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM27E3Q08E93 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FAM27E3Q08E93 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM27E3Q08E93 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM27E3Q08E93 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM27E3Q08E93 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM27E3Q08E93 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM27E3Q08E93 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM27E3Q08E93 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM27E3Q08E93 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM27E3Q08E93 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM27E3Q08E93 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM27E3Q08E93 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM27E3Q08E93 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM27E3Q08E93 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM27E3Q08E93 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM27E3Q08E93 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM27E3Q08E93 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM27E3Q08E93 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM27E3Q08E93 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM27E3Q08E93 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM27E3Q08E93 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms