Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4CQ08493 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4CQ08493 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE4CQ08493 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE4CQ08493 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE4CQ08493 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE4CQ08493 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE4CQ08493 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE4CQ08493 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE4CQ08493 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE4CQ08493 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE4CQ08493 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE4CQ08493 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE4CQ08493 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE4CQ08493 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE4CQ08493 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE4CQ08493 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE4CQ08493 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE4CQ08493 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE4CQ08493 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE4CQ08493 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE4CQ08493 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE4CQ08493 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE4CQ08493 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE4CQ08493 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE4CQ08493 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE4CQ08493 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE4CQ08493 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE4CQ08493 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE4CQ08493 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE4CQ08493 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE4CQ08493 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE4CQ08493 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDE4CQ08493 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE4CQ08493 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE4CQ08493 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE4CQ08493 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE4CQ08493 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE4CQ08493 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE4CQ08493 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE4CQ08493 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE4CQ08493 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE4CQ08493 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE4CQ08493 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE4CQ08493 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE4CQ08493 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE4CQ08493 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE4CQ08493 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE4CQ08493 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE4CQ08493 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE4CQ08493 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE4CQ08493 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE4CQ08493 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE4CQ08493 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE4CQ08493 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE4CQ08493 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE4CQ08493 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE4CQ08493 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE4CQ08493 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE4CQ08493 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE4CQ08493 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE4CQ08493 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE4CQ08493 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE4CQ08493 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE4CQ08493 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE4CQ08493 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE4CQ08493 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE4CQ08493 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE4CQ08493 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE4CQ08493 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE4CQ08493 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE4CQ08493 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE4CQ08493 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE4CQ08493 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE4CQ08493 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE4CQ08493 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE4CQ08493 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE4CQ08493 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE4CQ08493 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE4CQ08493 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE4CQ08493 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE4CQ08493 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE4CQ08493 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE4CQ08493 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE4CQ08493 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE4CQ08493 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE4CQ08493 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE4CQ08493 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE4CQ08493 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE4CQ08493 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE4CQ08493 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4CQ08493 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4CQ08493 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4CQ08493 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4CQ08493 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4CQ08493 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4CQ08493 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE4CQ08493 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE4CQ08493 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE4CQ08493 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms