Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
DDR1Q08345 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
DDR1Q08345 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
DDR1Q08345 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
DDR1Q08345 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
DDR1Q08345 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
DDR1Q08345 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
DDR1Q08345 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
DDR1Q08345 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
DDR1Q08345 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
DDR1Q08345 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
DDR1Q08345 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
DDR1Q08345 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
DDR1Q08345 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
DDR1Q08345 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
DDR1Q08345 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
DDR1Q08345 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
DDR1Q08345 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
DDR1Q08345 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
DDR1Q08345 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
DDR1Q08345 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
DDR1Q08345 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
DDR1Q08345 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
DDR1Q08345 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
DDR1Q08345 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
DDR1Q08345 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
DDR1Q08345 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
DDR1Q08345 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
DDR1Q08345 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
DDR1Q08345 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
DDR1Q08345 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
DDR1Q08345 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
DDR1Q08345 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DDR1Q08345 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DDR1Q08345 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DDR1Q08345 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
DDR1Q08345 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DDR1Q08345 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DDR1Q08345 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DDR1Q08345 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DDR1Q08345 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DDR1Q08345 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
DDR1Q08345 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
DDR1Q08345 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
DDR1Q08345 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
DDR1Q08345 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
DDR1Q08345 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
DDR1Q08345 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
DDR1Q08345 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
DDR1Q08345 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
DDR1Q08345 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
DDR1Q08345 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
DDR1Q08345 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
DDR1Q08345 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
DDR1Q08345 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
DDR1Q08345 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
DDR1Q08345 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
DDR1Q08345 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
DDR1Q08345 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
DDR1Q08345 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
DDR1Q08345 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
DDR1Q08345 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
DDR1Q08345 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
DDR1Q08345 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
DDR1Q08345 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
DDR1Q08345 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
DDR1Q08345 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
DDR1Q08345 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
DDR1Q08345 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
DDR1Q08345 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
DDR1Q08345 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
DDR1Q08345 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
DDR1Q08345 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
DDR1Q08345 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
DDR1Q08345 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
DDR1Q08345 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
DDR1Q08345 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
DDR1Q08345 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
DDR1Q08345 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
DDR1Q08345 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
DDR1Q08345 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DDR1Q08345 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DDR1Q08345 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DDR1Q08345 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
DDR1Q08345 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
DDR1Q08345 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
DDR1Q08345 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
DDR1Q08345 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
DDR1Q08345 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
DDR1Q08345 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
DDR1Q08345 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
DDR1Q08345 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
DDR1Q08345 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
DDR1Q08345 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
DDR1Q08345 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
DDR1Q08345 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
DDR1Q08345 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
DDR1Q08345 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
DDR1Q08345 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
DDR1Q08345 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms