Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EGR3Q06889 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EGR3Q06889 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EGR3Q06889 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EGR3Q06889 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGR3Q06889 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGR3Q06889 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGR3Q06889 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGR3Q06889 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGR3Q06889 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGR3Q06889 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGR3Q06889 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EGR3Q06889 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGR3Q06889 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGR3Q06889 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EGR3Q06889 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EGR3Q06889 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EGR3Q06889 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EGR3Q06889 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EGR3Q06889 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGR3Q06889 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EGR3Q06889 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EGR3Q06889 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EGR3Q06889 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EGR3Q06889 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EGR3Q06889 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EGR3Q06889 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EGR3Q06889 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EGR3Q06889 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EGR3Q06889 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EGR3Q06889 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EGR3Q06889 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EGR3Q06889 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EGR3Q06889 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EGR3Q06889 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGR3Q06889 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGR3Q06889 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EGR3Q06889 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EGR3Q06889 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EGR3Q06889 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EGR3Q06889 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EGR3Q06889 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGR3Q06889 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGR3Q06889 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGR3Q06889 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGR3Q06889 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGR3Q06889 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGR3Q06889 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGR3Q06889 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGR3Q06889 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGR3Q06889 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGR3Q06889 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGR3Q06889 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGR3Q06889 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGR3Q06889 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGR3Q06889 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EGR3Q06889 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EGR3Q06889 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGR3Q06889 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGR3Q06889 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EGR3Q06889 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGR3Q06889 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGR3Q06889 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGR3Q06889 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGR3Q06889 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGR3Q06889 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EGR3Q06889 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGR3Q06889 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGR3Q06889 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGR3Q06889 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EGR3Q06889 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EGR3Q06889 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EGR3Q06889 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EGR3Q06889 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EGR3Q06889 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EGR3Q06889 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EGR3Q06889 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EGR3Q06889 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EGR3Q06889 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EGR3Q06889 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EGR3Q06889 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EGR3Q06889 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EGR3Q06889 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EGR3Q06889 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EGR3Q06889 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EGR3Q06889 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EGR3Q06889 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EGR3Q06889 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EGR3Q06889 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EGR3Q06889 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EGR3Q06889 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EGR3Q06889 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EGR3Q06889 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EGR3Q06889 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EGR3Q06889 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EGR3Q06889 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EGR3Q06889 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGR3Q06889 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGR3Q06889 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGR3Q06889 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms