Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCDQ05655 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCDQ05655 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCDQ05655 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCDQ05655 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCDQ05655 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCDQ05655 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCDQ05655 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCDQ05655 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCDQ05655 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCDQ05655 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCDQ05655 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCDQ05655 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCDQ05655 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCDQ05655 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCDQ05655 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCDQ05655 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCDQ05655 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCDQ05655 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCDQ05655 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCDQ05655 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCDQ05655 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCDQ05655 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCDQ05655 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCDQ05655 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCDQ05655 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCDQ05655 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCDQ05655 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCDQ05655 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCDQ05655 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCDQ05655 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCDQ05655 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCDQ05655 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCDQ05655 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCDQ05655 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCDQ05655 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCDQ05655 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCDQ05655 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCDQ05655 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCDQ05655 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCDQ05655 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCDQ05655 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCDQ05655 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCDQ05655 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCDQ05655 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCDQ05655 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCDQ05655 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCDQ05655 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCDQ05655 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCDQ05655 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCDQ05655 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCDQ05655 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCDQ05655 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCDQ05655 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCDQ05655 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCDQ05655 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCDQ05655 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCDQ05655 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCDQ05655 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCDQ05655 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCDQ05655 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCDQ05655 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCDQ05655 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCDQ05655 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCDQ05655 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCDQ05655 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCDQ05655 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCDQ05655 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCDQ05655 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCDQ05655 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms