Protein–RNA interactions for Protein: Q04756

HGFAC, Hepatocyte growth factor activator, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGFACQ04756 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HGFACQ04756 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HGFACQ04756 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HGFACQ04756 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HGFACQ04756 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HGFACQ04756 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HGFACQ04756 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HGFACQ04756 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HGFACQ04756 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HGFACQ04756 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HGFACQ04756 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HGFACQ04756 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HGFACQ04756 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HGFACQ04756 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HGFACQ04756 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HGFACQ04756 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HGFACQ04756 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HGFACQ04756 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HGFACQ04756 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HGFACQ04756 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HGFACQ04756 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HGFACQ04756 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HGFACQ04756 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HGFACQ04756 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HGFACQ04756 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HGFACQ04756 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HGFACQ04756 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HGFACQ04756 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HGFACQ04756 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HGFACQ04756 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HGFACQ04756 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HGFACQ04756 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HGFACQ04756 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HGFACQ04756 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HGFACQ04756 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HGFACQ04756 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HGFACQ04756 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HGFACQ04756 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HGFACQ04756 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HGFACQ04756 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HGFACQ04756 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HGFACQ04756 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HGFACQ04756 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HGFACQ04756 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HGFACQ04756 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HGFACQ04756 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HGFACQ04756 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HGFACQ04756 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HGFACQ04756 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HGFACQ04756 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HGFACQ04756 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HGFACQ04756 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HGFACQ04756 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HGFACQ04756 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HGFACQ04756 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HGFACQ04756 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HGFACQ04756 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HGFACQ04756 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HGFACQ04756 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HGFACQ04756 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HGFACQ04756 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HGFACQ04756 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HGFACQ04756 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HGFACQ04756 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HGFACQ04756 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HGFACQ04756 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HGFACQ04756 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HGFACQ04756 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HGFACQ04756 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HGFACQ04756 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HGFACQ04756 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HGFACQ04756 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HGFACQ04756 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms