Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PAX5Q02548 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAX5Q02548 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAX5Q02548 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAX5Q02548 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAX5Q02548 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAX5Q02548 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAX5Q02548 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAX5Q02548 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAX5Q02548 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAX5Q02548 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAX5Q02548 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAX5Q02548 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAX5Q02548 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAX5Q02548 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAX5Q02548 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAX5Q02548 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAX5Q02548 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAX5Q02548 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAX5Q02548 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAX5Q02548 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAX5Q02548 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX5Q02548 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX5Q02548 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX5Q02548 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX5Q02548 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX5Q02548 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAX5Q02548 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAX5Q02548 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAX5Q02548 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAX5Q02548 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX5Q02548 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX5Q02548 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX5Q02548 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX5Q02548 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX5Q02548 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX5Q02548 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX5Q02548 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX5Q02548 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX5Q02548 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX5Q02548 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX5Q02548 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX5Q02548 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX5Q02548 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX5Q02548 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAX5Q02548 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAX5Q02548 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAX5Q02548 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAX5Q02548 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAX5Q02548 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAX5Q02548 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAX5Q02548 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PAX5Q02548 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAX5Q02548 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAX5Q02548 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAX5Q02548 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAX5Q02548 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAX5Q02548 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAX5Q02548 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PAX5Q02548 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAX5Q02548 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PAX5Q02548 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAX5Q02548 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAX5Q02548 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAX5Q02548 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAX5Q02548 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAX5Q02548 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAX5Q02548 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAX5Q02548 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAX5Q02548 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAX5Q02548 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAX5Q02548 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAX5Q02548 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAX5Q02548 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAX5Q02548 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAX5Q02548 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAX5Q02548 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PAX5Q02548 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAX5Q02548 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PAX5Q02548 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAX5Q02548 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAX5Q02548 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAX5Q02548 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAX5Q02548 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAX5Q02548 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAX5Q02548 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAX5Q02548 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAX5Q02548 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAX5Q02548 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAX5Q02548 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAX5Q02548 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAX5Q02548 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAX5Q02548 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAX5Q02548 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAX5Q02548 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAX5Q02548 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAX5Q02548 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAX5Q02548 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAX5Q02548 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAX5Q02548 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms