Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLCB3Q01970 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLCB3Q01970 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLCB3Q01970 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PLCB3Q01970 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLCB3Q01970 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLCB3Q01970 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLCB3Q01970 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLCB3Q01970 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLCB3Q01970 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLCB3Q01970 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PLCB3Q01970 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PLCB3Q01970 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLCB3Q01970 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLCB3Q01970 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLCB3Q01970 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PLCB3Q01970 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PLCB3Q01970 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PLCB3Q01970 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PLCB3Q01970 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLCB3Q01970 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLCB3Q01970 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLCB3Q01970 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLCB3Q01970 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLCB3Q01970 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PLCB3Q01970 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLCB3Q01970 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLCB3Q01970 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLCB3Q01970 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLCB3Q01970 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLCB3Q01970 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLCB3Q01970 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLCB3Q01970 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLCB3Q01970 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLCB3Q01970 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLCB3Q01970 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLCB3Q01970 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLCB3Q01970 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLCB3Q01970 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PLCB3Q01970 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PLCB3Q01970 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PLCB3Q01970 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PLCB3Q01970 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLCB3Q01970 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLCB3Q01970 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLCB3Q01970 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLCB3Q01970 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLCB3Q01970 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLCB3Q01970 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLCB3Q01970 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLCB3Q01970 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLCB3Q01970 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLCB3Q01970 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLCB3Q01970 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLCB3Q01970 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLCB3Q01970 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLCB3Q01970 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLCB3Q01970 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLCB3Q01970 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLCB3Q01970 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLCB3Q01970 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PLCB3Q01970 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PLCB3Q01970 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PLCB3Q01970 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PLCB3Q01970 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PLCB3Q01970 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLCB3Q01970 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLCB3Q01970 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLCB3Q01970 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLCB3Q01970 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PLCB3Q01970 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLCB3Q01970 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLCB3Q01970 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLCB3Q01970 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLCB3Q01970 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLCB3Q01970 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLCB3Q01970 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLCB3Q01970 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLCB3Q01970 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLCB3Q01970 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLCB3Q01970 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLCB3Q01970 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLCB3Q01970 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLCB3Q01970 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLCB3Q01970 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLCB3Q01970 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLCB3Q01970 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PLCB3Q01970 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PLCB3Q01970 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PLCB3Q01970 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PLCB3Q01970 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PLCB3Q01970 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PLCB3Q01970 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PLCB3Q01970 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PLCB3Q01970 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PLCB3Q01970 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLCB3Q01970 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLCB3Q01970 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PLCB3Q01970 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLCB3Q01970 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms