Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A2Q01362 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A2Q01362 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A2Q01362 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A2Q01362 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A2Q01362 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A2Q01362 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MS4A2Q01362 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A2Q01362 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A2Q01362 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A2Q01362 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A2Q01362 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A2Q01362 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A2Q01362 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A2Q01362 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A2Q01362 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A2Q01362 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A2Q01362 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A2Q01362 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A2Q01362 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A2Q01362 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A2Q01362 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A2Q01362 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A2Q01362 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A2Q01362 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A2Q01362 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A2Q01362 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MS4A2Q01362 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A2Q01362 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A2Q01362 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A2Q01362 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A2Q01362 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A2Q01362 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A2Q01362 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A2Q01362 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A2Q01362 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A2Q01362 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A2Q01362 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A2Q01362 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A2Q01362 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MS4A2Q01362 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A2Q01362 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A2Q01362 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A2Q01362 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A2Q01362 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A2Q01362 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A2Q01362 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A2Q01362 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A2Q01362 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A2Q01362 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A2Q01362 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A2Q01362 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A2Q01362 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A2Q01362 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A2Q01362 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A2Q01362 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A2Q01362 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A2Q01362 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A2Q01362 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A2Q01362 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A2Q01362 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A2Q01362 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A2Q01362 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A2Q01362 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A2Q01362 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A2Q01362 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A2Q01362 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A2Q01362 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A2Q01362 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A2Q01362 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MS4A2Q01362 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A2Q01362 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A2Q01362 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A2Q01362 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A2Q01362 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A2Q01362 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A2Q01362 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A2Q01362 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A2Q01362 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A2Q01362 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A2Q01362 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A2Q01362 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A2Q01362 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A2Q01362 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A2Q01362 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A2Q01362 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A2Q01362 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A2Q01362 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A2Q01362 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A2Q01362 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A2Q01362 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A2Q01362 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A2Q01362 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A2Q01362 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A2Q01362 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A2Q01362 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MS4A2Q01362 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A2Q01362 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A2Q01362 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A2Q01362 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms