Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BEX3Q00994 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BEX3Q00994 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BEX3Q00994 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BEX3Q00994 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BEX3Q00994 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BEX3Q00994 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
BEX3Q00994 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
BEX3Q00994 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
BEX3Q00994 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BEX3Q00994 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BEX3Q00994 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BEX3Q00994 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BEX3Q00994 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BEX3Q00994 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BEX3Q00994 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BEX3Q00994 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BEX3Q00994 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BEX3Q00994 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BEX3Q00994 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BEX3Q00994 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BEX3Q00994 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BEX3Q00994 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BEX3Q00994 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BEX3Q00994 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BEX3Q00994 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BEX3Q00994 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BEX3Q00994 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BEX3Q00994 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BEX3Q00994 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
BEX3Q00994 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BEX3Q00994 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
BEX3Q00994 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
BEX3Q00994 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
BEX3Q00994 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
BEX3Q00994 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BEX3Q00994 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BEX3Q00994 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BEX3Q00994 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BEX3Q00994 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BEX3Q00994 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BEX3Q00994 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BEX3Q00994 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BEX3Q00994 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BEX3Q00994 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BEX3Q00994 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BEX3Q00994 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BEX3Q00994 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BEX3Q00994 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BEX3Q00994 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BEX3Q00994 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BEX3Q00994 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BEX3Q00994 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BEX3Q00994 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BEX3Q00994 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BEX3Q00994 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BEX3Q00994 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BEX3Q00994 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BEX3Q00994 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BEX3Q00994 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BEX3Q00994 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BEX3Q00994 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BEX3Q00994 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BEX3Q00994 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BEX3Q00994 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BEX3Q00994 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BEX3Q00994 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BEX3Q00994 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BEX3Q00994 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BEX3Q00994 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BEX3Q00994 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms