Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK17Q00537 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK17Q00537 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDK17Q00537 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK17Q00537 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK17Q00537 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK17Q00537 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK17Q00537 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK17Q00537 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK17Q00537 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK17Q00537 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK17Q00537 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK17Q00537 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK17Q00537 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK17Q00537 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK17Q00537 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK17Q00537 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK17Q00537 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK17Q00537 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK17Q00537 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK17Q00537 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK17Q00537 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK17Q00537 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDK17Q00537 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDK17Q00537 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK17Q00537 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK17Q00537 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK17Q00537 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK17Q00537 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK17Q00537 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK17Q00537 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK17Q00537 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK17Q00537 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK17Q00537 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK17Q00537 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK17Q00537 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK17Q00537 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK17Q00537 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK17Q00537 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK17Q00537 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK17Q00537 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK17Q00537 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK17Q00537 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK17Q00537 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK17Q00537 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK17Q00537 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK17Q00537 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK17Q00537 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK17Q00537 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK17Q00537 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK17Q00537 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK17Q00537 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK17Q00537 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK17Q00537 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK17Q00537 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK17Q00537 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK17Q00537 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK17Q00537 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK17Q00537 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK17Q00537 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK17Q00537 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK17Q00537 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK17Q00537 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK17Q00537 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK17Q00537 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK17Q00537 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK17Q00537 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK17Q00537 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK17Q00537 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK17Q00537 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK17Q00537 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK17Q00537 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK17Q00537 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK17Q00537 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK17Q00537 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK17Q00537 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK17Q00537 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK17Q00537 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK17Q00537 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK17Q00537 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK17Q00537 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK17Q00537 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK17Q00537 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK17Q00537 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK17Q00537 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK17Q00537 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK17Q00537 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK17Q00537 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK17Q00537 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK17Q00537 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK17Q00537 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK17Q00537 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK17Q00537 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK17Q00537 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK17Q00537 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK17Q00537 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK17Q00537 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK17Q00537 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK17Q00537 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK17Q00537 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms