Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFNB1P98172 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFNB1P98172 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFNB1P98172 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFNB1P98172 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFNB1P98172 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFNB1P98172 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFNB1P98172 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFNB1P98172 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFNB1P98172 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFNB1P98172 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFNB1P98172 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFNB1P98172 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFNB1P98172 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFNB1P98172 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFNB1P98172 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFNB1P98172 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFNB1P98172 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFNB1P98172 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFNB1P98172 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFNB1P98172 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFNB1P98172 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFNB1P98172 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFNB1P98172 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFNB1P98172 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFNB1P98172 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFNB1P98172 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFNB1P98172 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFNB1P98172 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFNB1P98172 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFNB1P98172 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EFNB1P98172 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFNB1P98172 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFNB1P98172 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFNB1P98172 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFNB1P98172 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFNB1P98172 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EFNB1P98172 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFNB1P98172 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFNB1P98172 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFNB1P98172 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFNB1P98172 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EFNB1P98172 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFNB1P98172 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFNB1P98172 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFNB1P98172 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFNB1P98172 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFNB1P98172 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFNB1P98172 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFNB1P98172 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFNB1P98172 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFNB1P98172 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFNB1P98172 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFNB1P98172 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFNB1P98172 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFNB1P98172 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFNB1P98172 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFNB1P98172 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFNB1P98172 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFNB1P98172 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFNB1P98172 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFNB1P98172 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFNB1P98172 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFNB1P98172 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFNB1P98172 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFNB1P98172 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFNB1P98172 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFNB1P98172 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFNB1P98172 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFNB1P98172 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFNB1P98172 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFNB1P98172 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFNB1P98172 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFNB1P98172 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFNB1P98172 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFNB1P98172 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFNB1P98172 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFNB1P98172 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFNB1P98172 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFNB1P98172 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNB1P98172 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFNB1P98172 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFNB1P98172 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFNB1P98172 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFNB1P98172 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EFNB1P98172 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EFNB1P98172 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms