Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PIP4K2BP78356 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PIP4K2BP78356 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PIP4K2BP78356 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
PIP4K2BP78356 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PIP4K2BP78356 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PIP4K2BP78356 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PIP4K2BP78356 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
PIP4K2BP78356 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PIP4K2BP78356 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PIP4K2BP78356 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PIP4K2BP78356 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PIP4K2BP78356 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PIP4K2BP78356 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PIP4K2BP78356 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PIP4K2BP78356 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PIP4K2BP78356 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PIP4K2BP78356 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PIP4K2BP78356 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PIP4K2BP78356 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PIP4K2BP78356 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PIP4K2BP78356 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PIP4K2BP78356 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PIP4K2BP78356 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PIP4K2BP78356 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PIP4K2BP78356 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
PIP4K2BP78356 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PIP4K2BP78356 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PIP4K2BP78356 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
PIP4K2BP78356 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
PIP4K2BP78356 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PIP4K2BP78356 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
PIP4K2BP78356 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PIP4K2BP78356 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PIP4K2BP78356 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PIP4K2BP78356 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PIP4K2BP78356 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PIP4K2BP78356 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
PIP4K2BP78356 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PIP4K2BP78356 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PIP4K2BP78356 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PIP4K2BP78356 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PIP4K2BP78356 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PIP4K2BP78356 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PIP4K2BP78356 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PIP4K2BP78356 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PIP4K2BP78356 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PIP4K2BP78356 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PIP4K2BP78356 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PIP4K2BP78356 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PIP4K2BP78356 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PIP4K2BP78356 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PIP4K2BP78356 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PIP4K2BP78356 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PIP4K2BP78356 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PIP4K2BP78356 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PIP4K2BP78356 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PIP4K2BP78356 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PIP4K2BP78356 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
PIP4K2BP78356 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
PIP4K2BP78356 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PIP4K2BP78356 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PIP4K2BP78356 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PIP4K2BP78356 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PIP4K2BP78356 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PIP4K2BP78356 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PIP4K2BP78356 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PIP4K2BP78356 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PIP4K2BP78356 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PIP4K2BP78356 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PIP4K2BP78356 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
PIP4K2BP78356 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PIP4K2BP78356 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PIP4K2BP78356 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PIP4K2BP78356 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PIP4K2BP78356 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
PIP4K2BP78356 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PIP4K2BP78356 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PIP4K2BP78356 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PIP4K2BP78356 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PIP4K2BP78356 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PIP4K2BP78356 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PIP4K2BP78356 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PIP4K2BP78356 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PIP4K2BP78356 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PIP4K2BP78356 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PIP4K2BP78356 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PIP4K2BP78356 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
PIP4K2BP78356 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PIP4K2BP78356 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PIP4K2BP78356 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PIP4K2BP78356 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PIP4K2BP78356 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PIP4K2BP78356 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
PIP4K2BP78356 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PIP4K2BP78356 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PIP4K2BP78356 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PIP4K2BP78356 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PIP4K2BP78356 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
PIP4K2BP78356 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms