Protein–RNA interactions for Protein: P78324

SIRPA, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPAP78324 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIRPAP78324 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIRPAP78324 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIRPAP78324 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRPAP78324 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRPAP78324 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRPAP78324 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRPAP78324 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRPAP78324 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRPAP78324 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRPAP78324 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRPAP78324 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRPAP78324 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRPAP78324 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRPAP78324 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRPAP78324 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRPAP78324 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRPAP78324 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRPAP78324 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRPAP78324 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRPAP78324 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRPAP78324 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRPAP78324 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRPAP78324 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRPAP78324 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRPAP78324 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIRPAP78324 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRPAP78324 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRPAP78324 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIRPAP78324 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRPAP78324 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRPAP78324 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRPAP78324 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRPAP78324 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIRPAP78324 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIRPAP78324 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIRPAP78324 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIRPAP78324 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRPAP78324 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRPAP78324 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRPAP78324 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIRPAP78324 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRPAP78324 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRPAP78324 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIRPAP78324 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SIRPAP78324 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRPAP78324 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIRPAP78324 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRPAP78324 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRPAP78324 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRPAP78324 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRPAP78324 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIRPAP78324 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRPAP78324 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIRPAP78324 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRPAP78324 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRPAP78324 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIRPAP78324 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIRPAP78324 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIRPAP78324 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIRPAP78324 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIRPAP78324 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIRPAP78324 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRPAP78324 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRPAP78324 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRPAP78324 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRPAP78324 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRPAP78324 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRPAP78324 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRPAP78324 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRPAP78324 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRPAP78324 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRPAP78324 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRPAP78324 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRPAP78324 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRPAP78324 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRPAP78324 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRPAP78324 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRPAP78324 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRPAP78324 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRPAP78324 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRPAP78324 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRPAP78324 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRPAP78324 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRPAP78324 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRPAP78324 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRPAP78324 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRPAP78324 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRPAP78324 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRPAP78324 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRPAP78324 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRPAP78324 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRPAP78324 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRPAP78324 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SIRPAP78324 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIRPAP78324 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIRPAP78324 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIRPAP78324 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIRPAP78324 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIRPAP78324 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms