Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HERVK_113P63132 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERVK_113P63132 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERVK_113P63132 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERVK_113P63132 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERVK_113P63132 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERVK_113P63132 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERVK_113P63132 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERVK_113P63132 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERVK_113P63132 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERVK_113P63132 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERVK_113P63132 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERVK_113P63132 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERVK_113P63132 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERVK_113P63132 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERVK_113P63132 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERVK_113P63132 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERVK_113P63132 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERVK_113P63132 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERVK_113P63132 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERVK_113P63132 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERVK_113P63132 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERVK_113P63132 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERVK_113P63132 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERVK_113P63132 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERVK_113P63132 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERVK_113P63132 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERVK_113P63132 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERVK_113P63132 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HERVK_113P63132 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERVK_113P63132 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERVK_113P63132 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERVK_113P63132 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERVK_113P63132 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERVK_113P63132 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERVK_113P63132 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERVK_113P63132 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERVK_113P63132 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERVK_113P63132 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERVK_113P63132 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERVK_113P63132 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERVK_113P63132 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERVK_113P63132 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERVK_113P63132 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERVK_113P63132 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERVK_113P63132 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERVK_113P63132 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERVK_113P63132 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERVK_113P63132 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERVK_113P63132 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERVK_113P63132 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERVK_113P63132 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERVK_113P63132 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HERVK_113P63132 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERVK_113P63132 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERVK_113P63132 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113P63132 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113P63132 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113P63132 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113P63132 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113P63132 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERVK_113P63132 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HERVK_113P63132 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERVK_113P63132 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERVK_113P63132 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERVK_113P63132 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERVK_113P63132 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERVK_113P63132 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERVK_113P63132 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERVK_113P63132 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERVK_113P63132 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERVK_113P63132 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERVK_113P63132 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERVK_113P63132 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERVK_113P63132 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERVK_113P63132 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERVK_113P63132 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERVK_113P63132 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HERVK_113P63132 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERVK_113P63132 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERVK_113P63132 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERVK_113P63132 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERVK_113P63132 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERVK_113P63132 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERVK_113P63132 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERVK_113P63132 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERVK_113P63132 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERVK_113P63132 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERVK_113P63132 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERVK_113P63132 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERVK_113P63132 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERVK_113P63132 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERVK_113P63132 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERVK_113P63132 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERVK_113P63132 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERVK_113P63132 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERVK_113P63132 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERVK_113P63132 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERVK_113P63132 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERVK_113P63132 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms