Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL39P62891 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL39P62891 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL39P62891 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL39P62891 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL39P62891 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL39P62891 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL39P62891 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL39P62891 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL39P62891 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL39P62891 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL39P62891 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL39P62891 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL39P62891 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL39P62891 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL39P62891 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL39P62891 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL39P62891 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL39P62891 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL39P62891 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL39P62891 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL39P62891 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RPL39P62891 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL39P62891 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL39P62891 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL39P62891 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL39P62891 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL39P62891 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL39P62891 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL39P62891 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL39P62891 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL39P62891 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL39P62891 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL39P62891 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL39P62891 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL39P62891 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL39P62891 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL39P62891 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL39P62891 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL39P62891 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL39P62891 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL39P62891 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL39P62891 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL39P62891 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL39P62891 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL39P62891 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL39P62891 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL39P62891 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL39P62891 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL39P62891 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL39P62891 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL39P62891 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL39P62891 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL39P62891 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL39P62891 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL39P62891 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL39P62891 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P62891 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P62891 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P62891 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P62891 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P62891 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL39P62891 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL39P62891 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL39P62891 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL39P62891 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL39P62891 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL39P62891 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL39P62891 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL39P62891 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL39P62891 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL39P62891 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL39P62891 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL39P62891 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL39P62891 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL39P62891 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL39P62891 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL39P62891 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL39P62891 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL39P62891 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL39P62891 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL39P62891 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL39P62891 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL39P62891 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL39P62891 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL39P62891 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL39P62891 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL39P62891 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL39P62891 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL39P62891 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL39P62891 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL39P62891 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL39P62891 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL39P62891 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL39P62891 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL39P62891 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL39P62891 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL39P62891 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL39P62891 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL39P62891 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms