Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL30P62888 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL30P62888 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL30P62888 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL30P62888 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RPL30P62888 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL30P62888 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL30P62888 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL30P62888 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL30P62888 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL30P62888 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL30P62888 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL30P62888 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL30P62888 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL30P62888 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL30P62888 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL30P62888 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL30P62888 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL30P62888 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL30P62888 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL30P62888 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL30P62888 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL30P62888 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL30P62888 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL30P62888 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL30P62888 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL30P62888 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL30P62888 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL30P62888 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL30P62888 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL30P62888 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL30P62888 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL30P62888 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL30P62888 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL30P62888 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL30P62888 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL30P62888 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL30P62888 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL30P62888 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL30P62888 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL30P62888 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL30P62888 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL30P62888 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL30P62888 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL30P62888 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL30P62888 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL30P62888 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL30P62888 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL30P62888 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL30P62888 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL30P62888 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL30P62888 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL30P62888 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL30P62888 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL30P62888 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPL30P62888 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL30P62888 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL30P62888 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL30P62888 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL30P62888 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL30P62888 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL30P62888 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL30P62888 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL30P62888 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL30P62888 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPL30P62888 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL30P62888 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL30P62888 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL30P62888 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL30P62888 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL30P62888 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL30P62888 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL30P62888 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL30P62888 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL30P62888 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL30P62888 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL30P62888 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPL30P62888 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL30P62888 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL30P62888 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL30P62888 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL30P62888 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL30P62888 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL30P62888 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL30P62888 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL30P62888 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL30P62888 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL30P62888 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL30P62888 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL30P62888 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL30P62888 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL30P62888 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL30P62888 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL30P62888 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL30P62888 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL30P62888 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RPL30P62888 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL30P62888 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL30P62888 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL30P62888 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms