Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2LP62875 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2LP62875 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2LP62875 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2LP62875 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2LP62875 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLR2LP62875 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLR2LP62875 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR2LP62875 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2LP62875 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2LP62875 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2LP62875 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2LP62875 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2LP62875 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2LP62875 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2LP62875 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2LP62875 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2LP62875 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2LP62875 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2LP62875 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2LP62875 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2LP62875 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR2LP62875 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR2LP62875 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2LP62875 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2LP62875 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2LP62875 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2LP62875 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2LP62875 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2LP62875 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2LP62875 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2LP62875 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2LP62875 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2LP62875 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2LP62875 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR2LP62875 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR2LP62875 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR2LP62875 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2LP62875 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2LP62875 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2LP62875 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR2LP62875 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR2LP62875 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2LP62875 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2LP62875 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2LP62875 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2LP62875 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2LP62875 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2LP62875 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2LP62875 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2LP62875 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2LP62875 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2LP62875 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2LP62875 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2LP62875 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2LP62875 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2LP62875 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2LP62875 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2LP62875 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2LP62875 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2LP62875 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2LP62875 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2LP62875 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2LP62875 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2LP62875 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2LP62875 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2LP62875 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2LP62875 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2LP62875 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2LP62875 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2LP62875 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2LP62875 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2LP62875 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2LP62875 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2LP62875 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2LP62875 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2LP62875 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2LP62875 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2LP62875 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2LP62875 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR2LP62875 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR2LP62875 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR2LP62875 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2LP62875 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2LP62875 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2LP62875 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR2LP62875 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2LP62875 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2LP62875 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2LP62875 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2LP62875 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2LP62875 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2LP62875 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2LP62875 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2LP62875 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2LP62875 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR2LP62875 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR2LP62875 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR2LP62875 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2LP62875 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms