Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1CAP62136 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1CAP62136 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1CAP62136 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1CAP62136 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP1CAP62136 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1CAP62136 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1CAP62136 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1CAP62136 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1CAP62136 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1CAP62136 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1CAP62136 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1CAP62136 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1CAP62136 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1CAP62136 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1CAP62136 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1CAP62136 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1CAP62136 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1CAP62136 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1CAP62136 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1CAP62136 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPP1CAP62136 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1CAP62136 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1CAP62136 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1CAP62136 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1CAP62136 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1CAP62136 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1CAP62136 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1CAP62136 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1CAP62136 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1CAP62136 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1CAP62136 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1CAP62136 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1CAP62136 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1CAP62136 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1CAP62136 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1CAP62136 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1CAP62136 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1CAP62136 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1CAP62136 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1CAP62136 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1CAP62136 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1CAP62136 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1CAP62136 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1CAP62136 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1CAP62136 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1CAP62136 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1CAP62136 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1CAP62136 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1CAP62136 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1CAP62136 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1CAP62136 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1CAP62136 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1CAP62136 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1CAP62136 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1CAP62136 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1CAP62136 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1CAP62136 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1CAP62136 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1CAP62136 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1CAP62136 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1CAP62136 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP1CAP62136 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1CAP62136 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1CAP62136 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1CAP62136 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1CAP62136 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1CAP62136 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1CAP62136 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1CAP62136 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1CAP62136 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1CAP62136 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1CAP62136 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1CAP62136 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1CAP62136 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1CAP62136 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1CAP62136 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1CAP62136 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1CAP62136 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1CAP62136 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1CAP62136 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1CAP62136 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1CAP62136 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP1CAP62136 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP1CAP62136 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP1CAP62136 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPP1CAP62136 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPP1CAP62136 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPP1CAP62136 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1CAP62136 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1CAP62136 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1CAP62136 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1CAP62136 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1CAP62136 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1CAP62136 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1CAP62136 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1CAP62136 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP1CAP62136 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1CAP62136 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1CAP62136 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms