Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVK11-1P61568 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK11-1P61568 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK11-1P61568 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK11-1P61568 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK11-1P61568 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK11-1P61568 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK11-1P61568 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK11-1P61568 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK11-1P61568 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK11-1P61568 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK11-1P61568 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK11-1P61568 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK11-1P61568 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK11-1P61568 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK11-1P61568 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK11-1P61568 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK11-1P61568 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK11-1P61568 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK11-1P61568 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVK11-1P61568 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVK11-1P61568 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVK11-1P61568 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVK11-1P61568 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK11-1P61568 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK11-1P61568 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK11-1P61568 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK11-1P61568 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK11-1P61568 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK11-1P61568 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK11-1P61568 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK11-1P61568 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK11-1P61568 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK11-1P61568 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK11-1P61568 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK11-1P61568 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK11-1P61568 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK11-1P61568 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK11-1P61568 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK11-1P61568 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK11-1P61568 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK11-1P61568 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK11-1P61568 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK11-1P61568 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK11-1P61568 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK11-1P61568 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK11-1P61568 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK11-1P61568 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK11-1P61568 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK11-1P61568 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK11-1P61568 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK11-1P61568 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK11-1P61568 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK11-1P61568 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK11-1P61568 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK11-1P61568 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK11-1P61568 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK11-1P61568 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK11-1P61568 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK11-1P61568 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK11-1P61568 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK11-1P61568 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK11-1P61568 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK11-1P61568 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK11-1P61568 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK11-1P61568 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK11-1P61568 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK11-1P61568 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK11-1P61568 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK11-1P61568 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK11-1P61568 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms