Protein–RNA interactions for Protein: P61289

PSME3, Proteasome activator complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3P61289 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PSME3P61289 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME3P61289 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME3P61289 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME3P61289 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME3P61289 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME3P61289 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME3P61289 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSME3P61289 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSME3P61289 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSME3P61289 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSME3P61289 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSME3P61289 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSME3P61289 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSME3P61289 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSME3P61289 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSME3P61289 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSME3P61289 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSME3P61289 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSME3P61289 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME3P61289 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME3P61289 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME3P61289 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME3P61289 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSME3P61289 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSME3P61289 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSME3P61289 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSME3P61289 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSME3P61289 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSME3P61289 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PSME3P61289 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME3P61289 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME3P61289 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME3P61289 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSME3P61289 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSME3P61289 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSME3P61289 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSME3P61289 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSME3P61289 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSME3P61289 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSME3P61289 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSME3P61289 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSME3P61289 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSME3P61289 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSME3P61289 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSME3P61289 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSME3P61289 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSME3P61289 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSME3P61289 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSME3P61289 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSME3P61289 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSME3P61289 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSME3P61289 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME3P61289 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME3P61289 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME3P61289 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME3P61289 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME3P61289 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSME3P61289 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSME3P61289 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSME3P61289 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSME3P61289 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSME3P61289 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME3P61289 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME3P61289 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME3P61289 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME3P61289 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSME3P61289 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSME3P61289 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSME3P61289 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSME3P61289 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSME3P61289 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSME3P61289 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSME3P61289 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSME3P61289 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSME3P61289 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSME3P61289 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSME3P61289 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSME3P61289 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSME3P61289 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSME3P61289 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSME3P61289 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSME3P61289 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PSME3P61289 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSME3P61289 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSME3P61289 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSME3P61289 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME3P61289 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME3P61289 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME3P61289 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME3P61289 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME3P61289 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME3P61289 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME3P61289 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME3P61289 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME3P61289 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME3P61289 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME3P61289 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME3P61289 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME3P61289 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms