Protein–RNA interactions for Protein: P61073

CXCR4, C-X-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR4P61073 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCR4P61073 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCR4P61073 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCR4P61073 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCR4P61073 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCR4P61073 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCR4P61073 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCR4P61073 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCR4P61073 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCR4P61073 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCR4P61073 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCR4P61073 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCR4P61073 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCR4P61073 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCR4P61073 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCR4P61073 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCR4P61073 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCR4P61073 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCR4P61073 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCR4P61073 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCR4P61073 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCR4P61073 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCR4P61073 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCR4P61073 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCR4P61073 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCR4P61073 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXCR4P61073 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXCR4P61073 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCR4P61073 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCR4P61073 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCR4P61073 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CXCR4P61073 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CXCR4P61073 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCR4P61073 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCR4P61073 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCR4P61073 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCR4P61073 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCR4P61073 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCR4P61073 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCR4P61073 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCR4P61073 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCR4P61073 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXCR4P61073 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CXCR4P61073 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXCR4P61073 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXCR4P61073 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXCR4P61073 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXCR4P61073 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCR4P61073 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCR4P61073 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCR4P61073 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCR4P61073 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCR4P61073 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CXCR4P61073 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CXCR4P61073 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CXCR4P61073 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCR4P61073 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCR4P61073 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCR4P61073 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCR4P61073 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCR4P61073 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCR4P61073 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCR4P61073 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCR4P61073 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCR4P61073 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCR4P61073 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCR4P61073 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCR4P61073 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCR4P61073 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCR4P61073 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR4P61073 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR4P61073 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR4P61073 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR4P61073 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR4P61073 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR4P61073 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR4P61073 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR4P61073 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR4P61073 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR4P61073 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR4P61073 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CXCR4P61073 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCR4P61073 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCR4P61073 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCR4P61073 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCR4P61073 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR4P61073 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR4P61073 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR4P61073 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR4P61073 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR4P61073 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR4P61073 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR4P61073 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR4P61073 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR4P61073 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR4P61073 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR4P61073 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR4P61073 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR4P61073 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CXCR4P61073 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms