Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00315P59091 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00315P59091 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00315P59091 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00315P59091 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00315P59091 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00315P59091 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00315P59091 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00315P59091 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00315P59091 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00315P59091 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00315P59091 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00315P59091 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00315P59091 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00315P59091 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00315P59091 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00315P59091 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00315P59091 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00315P59091 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00315P59091 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00315P59091 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00315P59091 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00315P59091 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00315P59091 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00315P59091 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00315P59091 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00315P59091 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00315P59091 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00315P59091 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00315P59091 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00315P59091 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00315P59091 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00315P59091 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00315P59091 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00315P59091 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00315P59091 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00315P59091 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00315P59091 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00315P59091 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LINC00315P59091 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LINC00315P59091 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00315P59091 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00315P59091 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00315P59091 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00315P59091 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00315P59091 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00315P59091 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00315P59091 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00315P59091 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00315P59091 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00315P59091 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00315P59091 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00315P59091 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00315P59091 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00315P59091 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00315P59091 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00315P59091 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00315P59091 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00315P59091 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00315P59091 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00315P59091 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00315P59091 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00315P59091 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00315P59091 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00315P59091 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms