Protein–RNA interactions for Protein: P57073

SOX8, Transcription factor SOX-8, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX8P57073 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX8P57073 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX8P57073 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX8P57073 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX8P57073 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX8P57073 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX8P57073 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX8P57073 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX8P57073 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX8P57073 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX8P57073 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX8P57073 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX8P57073 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX8P57073 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SOX8P57073 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SOX8P57073 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX8P57073 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX8P57073 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX8P57073 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX8P57073 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX8P57073 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX8P57073 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX8P57073 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX8P57073 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX8P57073 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX8P57073 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX8P57073 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX8P57073 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX8P57073 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX8P57073 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX8P57073 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX8P57073 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX8P57073 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX8P57073 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX8P57073 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX8P57073 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX8P57073 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX8P57073 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX8P57073 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX8P57073 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX8P57073 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX8P57073 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX8P57073 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX8P57073 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX8P57073 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX8P57073 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX8P57073 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX8P57073 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX8P57073 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX8P57073 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX8P57073 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX8P57073 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX8P57073 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX8P57073 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX8P57073 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX8P57073 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX8P57073 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX8P57073 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX8P57073 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX8P57073 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX8P57073 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX8P57073 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX8P57073 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX8P57073 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX8P57073 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX8P57073 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX8P57073 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX8P57073 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX8P57073 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX8P57073 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX8P57073 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX8P57073 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX8P57073 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX8P57073 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SOX8P57073 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SOX8P57073 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX8P57073 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX8P57073 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX8P57073 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX8P57073 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX8P57073 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX8P57073 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX8P57073 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX8P57073 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX8P57073 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX8P57073 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX8P57073 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX8P57073 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX8P57073 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX8P57073 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX8P57073 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX8P57073 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX8P57073 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX8P57073 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX8P57073 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SOX8P57073 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX8P57073 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX8P57073 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX8P57073 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX8P57073 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms