Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
BACE1P56817 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
BACE1P56817 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
BACE1P56817 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
BACE1P56817 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
BACE1P56817 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
BACE1P56817 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
BACE1P56817 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
BACE1P56817 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BACE1P56817 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
BACE1P56817 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
BACE1P56817 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
BACE1P56817 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
BACE1P56817 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
BACE1P56817 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
BACE1P56817 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
BACE1P56817 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
BACE1P56817 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
BACE1P56817 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
BACE1P56817 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
BACE1P56817 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
BACE1P56817 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
BACE1P56817 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
BACE1P56817 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
BACE1P56817 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
BACE1P56817 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
BACE1P56817 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
BACE1P56817 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
BACE1P56817 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
BACE1P56817 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
BACE1P56817 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
BACE1P56817 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
BACE1P56817 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
BACE1P56817 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
BACE1P56817 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
BACE1P56817 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
BACE1P56817 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
BACE1P56817 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
BACE1P56817 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
BACE1P56817 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
BACE1P56817 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
BACE1P56817 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
BACE1P56817 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
BACE1P56817 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
BACE1P56817 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BACE1P56817 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BACE1P56817 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
BACE1P56817 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BACE1P56817 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
BACE1P56817 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
BACE1P56817 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
BACE1P56817 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BACE1P56817 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
BACE1P56817 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
BACE1P56817 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
BACE1P56817 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
BACE1P56817 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BACE1P56817 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
BACE1P56817 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BACE1P56817 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
BACE1P56817 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
BACE1P56817 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
BACE1P56817 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
BACE1P56817 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
BACE1P56817 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
BACE1P56817 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BACE1P56817 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BACE1P56817 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
BACE1P56817 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
BACE1P56817 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BACE1P56817 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
BACE1P56817 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BACE1P56817 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
BACE1P56817 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
BACE1P56817 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
BACE1P56817 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
BACE1P56817 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
BACE1P56817 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
BACE1P56817 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
BACE1P56817 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
BACE1P56817 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
BACE1P56817 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
BACE1P56817 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
BACE1P56817 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
BACE1P56817 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BACE1P56817 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BACE1P56817 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BACE1P56817 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BACE1P56817 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
BACE1P56817 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
BACE1P56817 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
BACE1P56817 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
BACE1P56817 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
BACE1P56817 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
BACE1P56817 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
BACE1P56817 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
BACE1P56817 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BACE1P56817 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BACE1P56817 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
BACE1P56817 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms