Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTBP2P56545 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTBP2P56545 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTBP2P56545 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTBP2P56545 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTBP2P56545 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTBP2P56545 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms