Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCL23P55773 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCL23P55773 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCL23P55773 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCL23P55773 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCL23P55773 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCL23P55773 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCL23P55773 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCL23P55773 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCL23P55773 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCL23P55773 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCL23P55773 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCL23P55773 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCL23P55773 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCL23P55773 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCL23P55773 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCL23P55773 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCL23P55773 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCL23P55773 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCL23P55773 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCL23P55773 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCL23P55773 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCL23P55773 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCL23P55773 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCL23P55773 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCL23P55773 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCL23P55773 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCL23P55773 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCL23P55773 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCL23P55773 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCL23P55773 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCL23P55773 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCL23P55773 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCL23P55773 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCL23P55773 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCL23P55773 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCL23P55773 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCL23P55773 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCL23P55773 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCL23P55773 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCL23P55773 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCL23P55773 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCL23P55773 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCL23P55773 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCL23P55773 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCL23P55773 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCL23P55773 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCL23P55773 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCL23P55773 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCL23P55773 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCL23P55773 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCL23P55773 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCL23P55773 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCL23P55773 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCL23P55773 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCL23P55773 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCL23P55773 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCL23P55773 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCL23P55773 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCL23P55773 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCL23P55773 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCL23P55773 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CCL23P55773 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCL23P55773 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCL23P55773 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCL23P55773 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCL23P55773 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCL23P55773 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCL23P55773 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCL23P55773 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CCL23P55773 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCL23P55773 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CCL23P55773 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCL23P55773 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCL23P55773 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCL23P55773 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCL23P55773 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCL23P55773 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCL23P55773 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CCL23P55773 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCL23P55773 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCL23P55773 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCL23P55773 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCL23P55773 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCL23P55773 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCL23P55773 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCL23P55773 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCL23P55773 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCL23P55773 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCL23P55773 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCL23P55773 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCL23P55773 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCL23P55773 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCL23P55773 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCL23P55773 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCL23P55773 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCL23P55773 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCL23P55773 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCL23P55773 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCL23P55773 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms