Protein–RNA interactions for Protein: P55316

FOXG1, Forkhead box protein G1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXG1P55316 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXG1P55316 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXG1P55316 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXG1P55316 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXG1P55316 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXG1P55316 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXG1P55316 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXG1P55316 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXG1P55316 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXG1P55316 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXG1P55316 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXG1P55316 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXG1P55316 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXG1P55316 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXG1P55316 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXG1P55316 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXG1P55316 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXG1P55316 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXG1P55316 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXG1P55316 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXG1P55316 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXG1P55316 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXG1P55316 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXG1P55316 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXG1P55316 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXG1P55316 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXG1P55316 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXG1P55316 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXG1P55316 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXG1P55316 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXG1P55316 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXG1P55316 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXG1P55316 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXG1P55316 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXG1P55316 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXG1P55316 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXG1P55316 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXG1P55316 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXG1P55316 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXG1P55316 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXG1P55316 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXG1P55316 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXG1P55316 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXG1P55316 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXG1P55316 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXG1P55316 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXG1P55316 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXG1P55316 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXG1P55316 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXG1P55316 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXG1P55316 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXG1P55316 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXG1P55316 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXG1P55316 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXG1P55316 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXG1P55316 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXG1P55316 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXG1P55316 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXG1P55316 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXG1P55316 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXG1P55316 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXG1P55316 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXG1P55316 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXG1P55316 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXG1P55316 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXG1P55316 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXG1P55316 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXG1P55316 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXG1P55316 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXG1P55316 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXG1P55316 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXG1P55316 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXG1P55316 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXG1P55316 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXG1P55316 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXG1P55316 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXG1P55316 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXG1P55316 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXG1P55316 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXG1P55316 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXG1P55316 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXG1P55316 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXG1P55316 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXG1P55316 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXG1P55316 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXG1P55316 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXG1P55316 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXG1P55316 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXG1P55316 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXG1P55316 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXG1P55316 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXG1P55316 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXG1P55316 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXG1P55316 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXG1P55316 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXG1P55316 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXG1P55316 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXG1P55316 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXG1P55316 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXG1P55316 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms