Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP6P55212 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP6P55212 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP6P55212 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP6P55212 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP6P55212 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP6P55212 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP6P55212 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP6P55212 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP6P55212 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP6P55212 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP6P55212 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP6P55212 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP6P55212 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP6P55212 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP6P55212 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP6P55212 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP6P55212 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP6P55212 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP6P55212 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP6P55212 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP6P55212 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP6P55212 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP6P55212 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP6P55212 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP6P55212 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP6P55212 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP6P55212 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP6P55212 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP6P55212 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP6P55212 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP6P55212 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP6P55212 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP6P55212 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP6P55212 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP6P55212 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP6P55212 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP6P55212 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP6P55212 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP6P55212 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP6P55212 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP6P55212 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP6P55212 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP6P55212 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP6P55212 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP6P55212 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP6P55212 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP6P55212 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP6P55212 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP6P55212 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP6P55212 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP6P55212 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP6P55212 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP6P55212 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP6P55212 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP6P55212 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP6P55212 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP6P55212 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP6P55212 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP6P55212 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP6P55212 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP6P55212 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP6P55212 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP6P55212 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP6P55212 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP6P55212 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP6P55212 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP6P55212 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP6P55212 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP6P55212 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP6P55212 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP6P55212 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP6P55212 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP6P55212 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP6P55212 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP6P55212 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP6P55212 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP6P55212 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP6P55212 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP6P55212 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP6P55212 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP6P55212 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP6P55212 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP6P55212 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP6P55212 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASP6P55212 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP6P55212 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP6P55212 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP6P55212 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP6P55212 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP6P55212 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP6P55212 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP6P55212 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP6P55212 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP6P55212 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP6P55212 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP6P55212 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP6P55212 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP6P55212 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP6P55212 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms